RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585291.5

NFE2L1-222, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2L1, Length 4,390 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFE2L1-222	ENST00000585291	PPP3CA	Q08209	521 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	TLR10	Q9BXR5	811 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	GAN	Q9H2C0	597 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	LRRD1	A4D1F6	860 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22	2e-9	■■■■■ 38.3
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZNF263	O14978	683 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	CCNE2	O96020	404 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	EPHX2	P34913	555 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	SLC8A3	P57103	927 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	PAF1	Q8N7H5	531 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	KAT5	Q92993	513 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	HVCN1	Q96D96	273 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	FUT8	Q9BYC5	575 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	EXTL3	O43909	919 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	KRT1	P04264	644 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	ATF2	P15336	505 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	HSPA6	P17066	643 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	COPB2	P35606	906 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	DMTN	Q08495	405 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291		M0QZ92	97 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	PLA2G4A	P47712	749 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	NNT	Q13423	1086 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	OPTN	Q96CV9	577 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	WNK4	Q96J92	1243 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	FAM84A	Q96KN4	292 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	RFC5	P40937	340 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	CCL15	Q16663	113 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	CCDC89	Q8N998	374 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	SCFD2	Q8WU76	684 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	SCN7A	Q01118	1682 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	NHS	Q6T4R5	1651 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	TTI1	O43156	1089 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	RAD51C	O43502	376 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	TLR2	O60603	784 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	MME	P08473	750 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	CLCN3	P51790	818 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	CUL1	Q13616	776 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	HAUS1	Q96CS2	278 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	ACP6	Q9NPH0	428 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	COMT	P21964	271 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	ANO5	Q75V66	913 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	USP38	Q8NB14	1042 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	TATDN2	Q93075	761 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291		E7EVH7	732 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	13.68	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	SLCO1A2	P46721	670 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	MYBPC2	Q14324	1141 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	EXOC4	Q96A65	974 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	BTBD6	Q96KE9	485 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
NFE2L1-222	ENST00000585291	PLAA	Q9Y263	795 aa		13.68	□□□□□ -0.22

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