RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 NASPP49321 788 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 NEK3P51956 506 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 GABREP78334 506 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 SCRN1Q12765 414 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 PDIA5Q14554 519 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 TNIP1Q15025 636 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 ACAP1Q15027 740 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 POSTNQ15063 836 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 RASA2Q15283 850 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 METTL24Q5JXM2 366 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 SPDYCQ5MJ68 293 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 GALNT17Q6IS24 598 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 RUFY3Q7L099 469 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 HOMER1Q86YM7 354 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 LILRB2Q8N423 598 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 ARRDC4Q8NCT1 418 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 NUDT10Q8NFP7 164 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 OR8H1Q8NGG4 311 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 JAKMIP2Q96AA8 810 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 CFAP36Q96G28 342 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 NUDT11Q96G61 164 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 AJUBAQ96IF1 538 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC37BQ96QE4 947 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 CRACR2AQ9BSW2 395 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 FANCFQ9NPI8 374 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 PSD3Q9NYI0 1048 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D7Q9P0N9 293 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 AKT3Q9Y243 479 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 C2CD2Q9Y426 696 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 TTLL3Q9Y4R7 772 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 IPPQ9Y573 584 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 RNF123Q5XPI4 1314 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 ZBED9Q6R2W3 1325 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 ESYT3A0FGR9 886 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 ALG1L2C9J202 215 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 H0YC42 278 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 KLHL41O60662 606 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 TBCAO75347 108 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 TADA3O75528 432 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 OFD1O75665 1012 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 STAM2O75886 525 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 RASGRP1O95267 797 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 RPS2P15880 293 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 GNAT2P19087 354 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 RDXP35241 583 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 ATP6V1E1P36543 226 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP3.41□□□□□ -1.866e-7■■■■■ 27.6
PTPRM-204ENST00000577468 HTR3AP46098 478 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 RIPK4P57078 832 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 AP2B1P63010 937 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 DEUP1Q05D60 604 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 MCL1Q07820 350 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC74AQ0VAA2 488 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 PICALMQ13492 652 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 PLCB4Q15147 1175 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD1Q15327 319 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 TNNI3KQ59H18 835 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 EMC4Q5J8M3 183 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 DACT2Q5SW24 774 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 HHATQ5VTY9 493 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 SFMBT2Q5VUG0 894 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 STEAP3Q658P3 488 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 IL31Q6EBC2 164 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 PLBD1Q6P4A8 553 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 LVRNQ6Q4G3 990 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 LDLRAD3Q86YD5 345 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 C1orf210Q8IVY1 113 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 SCUBE1Q8IWY4 988 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF654Q8IZM8 581 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 AFAP1Q8N556 730 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 MGARPQ8TDB4 240 aa3.41□□□□□ -1.86
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