RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 KCNMB3Q9NPA1 279 aa19.5■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa19.5■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 PARP2Q9UGN5 583 aa19.5■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 FAM170BA6NMN3 283 aa19.49■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 SPTLC1O15269 473 aa19.49■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 B4GALT5O43286 388 aa19.49■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 C1RP00736 705 aa19.49■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 C8AP07357 584 aa19.49■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 MBTD1Q05BQ5 628 aa19.49■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 GRIK3Q13003 919 aa19.49■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 AMHR2Q16671 573 aa19.49■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 SLC44A4Q53GD3 710 aa19.49■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 PPM1LQ5SGD2 360 aa19.49■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 MTSS1LQ765P7 747 aa19.49■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 OTUD6AQ7L8S5 288 aa19.49■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 KRT25Q7Z3Z0 450 aa19.49■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 CEP57Q86XR8 500 aa19.49■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 ITFG1Q8TB96 612 aa19.49■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 ASAP3Q8TDY4 903 aa19.49■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 KCNB2Q92953 911 aa19.49■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 FBXO4Q9UKT5 387 aa19.49■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 KCNJ14Q9UNX9 436 aa19.49■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP19.49■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 CASTOR2A6NHX0 329 aa19.48■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 DEXIO95424 95 aa19.48■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 HSPA4P34932 840 aa19.48■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 PRKCQQ04759 706 aa19.48■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 CAPSQ13938 189 aa19.48■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 TFDP1Q14186 410 aa19.48■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 EPHA7Q15375 998 aa19.48■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF528Q3MIS6 628 aa19.48■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 TSSK4Q6SA08 328 aa19.48■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 FBXL16Q8N461 479 aa19.48■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 ATRIPQ8WXE1 791 aa19.48■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 FAM20AQ96MK3 541 aa19.48■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 LTB4R2Q9NPC1 389 aa19.48■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 VWA8A3KMH1 1905 aa19.47■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa19.47■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 CPLX1O14810 134 aa19.47■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 MARCH6O60337 910 aa19.47■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 KIF4AO95239 1232 aa19.47■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP19.47■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP19.47■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 PSMD5Q16401 504 aa19.47■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 FAM171A1Q5VUB5 890 aa19.47■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 TPRG1Q6ZUI0 275 aa19.47■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 NEK8Q86SG6 692 aa19.47■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 GPR65Q8IYL9 337 aa19.47■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 ING5Q8WYH8 240 aa19.47■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 HAS1Q92839 578 aa19.47■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 CLSTN3Q9BQT9 956 aa19.47■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 PHF20Q9BVI0 1012 aa19.47■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa19.47■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa19.47■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 ADAM12O43184 909 aa19.46■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 SLC27A1Q6PCB7 646 aa19.46■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 POTEDQ86YR6 584 aa19.46■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 TPH2Q8IWU9 490 aa19.46■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 SLC7A14Q8TBB6 771 aa19.46■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 TTPALQ9BTX7 342 aa19.46■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa19.46■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 USP18Q9UMW8 372 aa19.46■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 NOTCH4Q99466 2003 aa19.46■□□□□ 0.71
CCDC40-211ENST00000574099 XYLBO75191 536 aa19.45■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 TARSP26639 723 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 EVCP57679 992 aa19.45■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 PFKPQ01813 784 aa19.45■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 STK3Q13188 491 aa19.45■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 TUSC3Q13454 348 aa19.45■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 GALNT17Q6IS24 598 aa19.45■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 PIK3R5Q8WYR1 880 aa19.45■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 ZSCAN32Q9NX65 697 aa19.45■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 GLRA2P23416 452 aa19.44■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa19.44■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 PPP4R3AQ6IN85 833 aa19.44■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa19.44■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 NPAS3Q8IXF0 933 aa19.44■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 ZBTB44Q8NCP5 570 aa19.44■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 OSBPL6Q9BZF3 934 aa19.44■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 EPC1Q9H2F5 836 aa19.44■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 SPTBN2O15020 2390 aa19.43■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 DCDC2BA2VCK2 349 aa19.43■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 PSMA5P28066 241 aa19.43■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 HOXA9P31269 272 aa19.43■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 LMNB2Q03252 620 aa19.43■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 SPIRE1Q08AE8 756 aa19.43■□□□□ 0.7
CCDC40-211ENST00000574099 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms