RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 STK17AQ9UEE5 414 aa18.78■□□□□ 0.6
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CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC16A4O15374 487 aa18.77■□□□□ 0.6
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
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CCNDBP1-211ENST00000567434 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
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CCNDBP1-211ENST00000567434 KIAA1841Q6NSI8 718 aa18.73■□□□□ 0.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 FUT10Q6P4F1 479 aa18.73■□□□□ 0.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYCE2Q6PIF2 218 aa18.73■□□□□ 0.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa18.73■□□□□ 0.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP49Q70CQ1 688 aa18.73■□□□□ 0.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 HAUS6Q7Z4H7 955 aa18.73■□□□□ 0.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYCT1Q8N699 235 aa18.73■□□□□ 0.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 LINC00301Q8NCQ3 95 aa18.73■□□□□ 0.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC22A17Q8WUG5 538 aa18.73■□□□□ 0.59
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