RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 MINDY3Q9H8M7 445 aa19.32■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP19.32■□□□□ 0.686e-9■■■■■ 134.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 APEX2Q9UBZ4 518 aa19.32■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIM10Q9UDY6 481 aa19.32■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa19.31■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 PMM2O15305 246 aa19.31■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLDN3O15551 220 aa19.31■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADAMTS4O75173 837 aa19.31■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 PGK1P00558 417 aa19.31■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 HOXC8P31273 242 aa19.31■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGEF6Q15052 776 aa19.31■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPA17Q15506 151 aa19.31■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa19.31■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa19.31■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa19.31■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP37Q86T82 979 aa19.31■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF410Q86VK4 478 aa19.31■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAET1EQ8TD07 263 aa19.31■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRIMPOLQ96LW4 560 aa19.31■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 WDR24Q96S15 920 aa19.31■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM8AQ9HCN3 771 aa19.31■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYO6Q9UM54 1294 aa19.31■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPC3P51654 580 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 WNT7BP56706 349 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDC42EP1Q00587 391 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 HIC1Q14526 733 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGAP44Q17R89 818 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 KRT39Q6A163 491 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGEF19Q8IW93 802 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 STK33Q9BYT3 514 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 HAUS4Q9H6D7 363 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 RCCD1A6NED2 376 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 ABLIM1O14639 778 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 FANCGO15287 622 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 B4GALT5O43286 388 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZEB2O60315 1214 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 IQCF3P0C7M6 154 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 PROZP22891 400 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 PSMD6Q15008 389 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM132AQ24JP5 1023 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 SEMA4DQ92854 862 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 FNBP1Q96RU3 617 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDE11AQ9HCR9 933 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTPRHQ9HD43 1115 aa19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIF5CO60282 957 aa19.29■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 GFPT2O94808 682 aa19.29■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 GNAT1P11488 350 aa19.29■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYP2C9P11712 490 aa19.29■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 GTF2H1P32780 548 aa19.29■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 STAT1P42224 750 aa19.29■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRMT2P55345 433 aa19.29■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 MCL1Q07820 350 aa19.29■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 AMHR2Q16671 573 aa19.29■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 SV2AQ7L0J3 742 aa19.29■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 KLHDC9Q8NEP7 349 aa19.29■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 NLRP7Q8WX94 980 aa19.29■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF516Q92618 1163 aa19.29■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 JAKMIP2Q96AA8 810 aa19.29■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP19.29■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 HDAC6Q9UBN7 1215 aa19.29■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 GUCA1BQ9UMX6 200 aa19.29■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa19.29■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 C17orf102A2RUQ5 167 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM189A1O60320 539 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 LCA5LO95447 670 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNNI1P19237 187 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 CST5P28325 142 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 CASQ1P31415 396 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLDN10P78369 228 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF569Q5MCW4 686 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC122Q5T0U0 273 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATF7IP2Q5U623 682 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 C7orf31Q8N865 590 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 LACRTQ9GZZ8 138 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADAMTS10Q9H324 1103 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNFSF13BQ9Y275 285 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 F8VZ95 297 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 SOX5P35711 763 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNFSF9P41273 254 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTK2Q05397 1052 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 MPZL3Q6UWV2 235 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 CXCL17Q6UXB2 119 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 RUFY4Q6ZNE9 571 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms