RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 KCNH6Q9H252 994 aa23.93■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 CACNG4Q9UBN1 327 aa23.93■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 GDAQ9Y2T3 454 aa23.93■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 CASTOR2A6NHX0 329 aa23.92■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 MCM2P49736 904 aa23.92■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 PEX3P56589 373 aa23.92■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 MTMR3Q13615 1198 aa23.92■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 IL17AQ16552 155 aa23.92■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 ATF7IP2Q5U623 682 aa23.92■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 EEF1DP3Q658K8 133 aa23.92■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 CCDC149Q6ZUS6 474 aa23.92■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 HASPINQ8TF76 798 aa23.92■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 RXFP1Q9HBX9 757 aa23.92■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 CHST7Q9NS84 486 aa23.92■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 LIMD1Q9UGP4 676 aa23.92■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 USTQ9Y2C2 406 aa23.92■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP23.91■■□□□ 1.424e-7■■■■■ 86.2
CIPC-208ENST00000557115 HIP1RO75146 1068 aa23.91■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 EFEMP2O95967 443 aa23.91■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa23.91■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 PALB2Q86YC2 1186 aa23.91■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 GLYCTKQ8IVS8 523 aa23.91■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 DRC1Q96MC2 740 aa23.91■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 SORCS3Q9UPU3 1222 aa23.91■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.91■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa23.9■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 EDN1P05305 212 aa23.9■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 CREMQ03060 361 aa23.9■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 NT5DC1Q5TFE4 455 aa23.9■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 OTOP3Q7RTS5 596 aa23.9■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 UBALD2Q8IYN6 164 aa23.9■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa23.9■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 FBXL6Q8N531 539 aa23.9■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 FEZF2Q8TBJ5 459 aa23.9■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 TECTAO75443 2155 aa23.89■■□□□ 1.42
CIPC-208ENST00000557115 PTGESO14684 152 aa23.89■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 ASGR2P07307 311 aa23.89■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 SPATA31D3P0C874 917 aa23.89■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 NPTX2P47972 431 aa23.89■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 RINT1Q6NUQ1 792 aa23.89■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa23.89■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 CEP57Q86XR8 500 aa23.89■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa23.89■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 PAAF1Q9BRP4 392 aa23.89■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 RUSC1Q9BVN2 902 aa23.89■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 KMT5AQ9NQR1 393 aa23.89■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.88■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 GPR65Q8IYL9 337 aa23.88■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
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CIPC-208ENST00000557115 TNFSF13BQ9Y275 285 aa23.88■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa23.87■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 KIF4AO95239 1232 aa23.87■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 BRD1O95696 1058 aa23.87■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 RPL17P18621 184 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 YARSP54577 528 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 FAM171A1Q5VUB5 890 aa23.87■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 KCNK18Q7Z418 384 aa23.87■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 PLIN2Q99541 437 aa23.87■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 TCHPQ9BT92 498 aa23.87■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 TTPALQ9BTX7 342 aa23.87■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 TIPINQ9BVW5 301 aa23.87■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.87■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 CXCL16Q9H2A7 254 aa23.87■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa23.87■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 TMEM134Q9H6X4 195 aa23.87■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 PIDD1Q9HB75 910 aa23.87■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
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CIPC-208ENST00000557115 ZNF568Q3ZCX4 644 aa23.86■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 GLRA4Q5JXX5 417 aa23.86■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
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CIPC-208ENST00000557115 C1orf186Q6ZWK4 172 aa23.86■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 DAW1Q8N136 415 aa23.86■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 HDAC7Q8WUI4 952 aa23.86■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 STAMQ92783 540 aa23.86■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 C17orf75Q9HAS0 396 aa23.86■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 TRIOO75962 3097 aa23.86■■□□□ 1.41
CIPC-208ENST00000557115 SFI1A8K8P3 1242 aa23.85■■□□□ 1.41
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