RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556416.1

CLMN-205, Transcript of calmin, humanhuman

TSL 2

Gene CLMN, Length 1,772 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMN-205ENST00000556416 TRAF7Q6Q0C0 670 aa25.49■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa25.49■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 BRSK2Q8IWQ3 736 aa25.49■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 ERGIC2Q96RQ1 377 aa25.49■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 C11orf49Q9H6J7 331 aa25.49■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 MMRN2Q9H8L6 949 aa25.49■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa25.49■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 WNT7BP56706 349 aa25.48■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 OSTNP61366 133 aa25.48■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 ENPEPQ07075 957 aa25.48■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 LPIN1Q14693 890 aa25.48■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 SYCP1Q15431 976 aa25.48■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 TRIM60Q495X7 471 aa25.48■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 FMO5P49326 533 aa25.47■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 C1orf53Q5VUE5 145 aa25.47■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 USP37Q86T82 979 aa25.47■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 TMEM192Q8IY95 271 aa25.47■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 ERVK-5Q9HDB9 667 aa25.47■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 GPR182O15218 404 aa25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 DLATP10515 647 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 CAPN2P17655 700 aa25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 CD52P31358 61 aa25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 PPP3CAQ08209 521 aa25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 BFSP2Q13515 415 aa25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 CCDC51Q96ER9 411 aa25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 PDE11AQ9HCR9 933 aa25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 SQORQ9Y6N5 450 aa25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 ITIH6Q6UXX5 1313 aa25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 STAG3L1P0CL83 205 aa25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 KLK7P49862 253 aa25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 TLE2Q04725 743 aa25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 PAK2Q13177 524 aa25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 KYAT1Q16773 422 aa25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 CBWD6Q4V339 395 aa25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 CBWD3Q5JTY5 395 aa25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 CBWD5Q5RIA9 395 aa25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 LRRC8DQ7L1W4 858 aa25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 PADI3Q9ULW8 664 aa25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 SIK3Q9Y2K2 1263 aa25.46■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 TRIP11Q15643 1979 aa25.45■■□□□ 1.67
CLMN-205ENST00000556416 DCDC2CA8MYV0 355 aa25.45■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 CLTAP09496 248 aa25.45■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 SELPP16109 830 aa25.45■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 GCLMP48507 274 aa25.45■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 MYL7Q01449 175 aa25.45■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 MBTPS1Q14703 1052 aa25.45■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 UBXN11Q5T124 520 aa25.45■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 USP38Q8NB14 1042 aa25.45■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 TOX2Q96NM4 488 aa25.45■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 FNBP1Q96RU3 617 aa25.45■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 STX10O60499 249 aa25.44■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 CXCL8P10145 99 aa25.44■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 GRM5P41594 1212 aa25.44■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 KCNMA1Q12791 1236 aa25.44■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 CRACR2AQ9BSW2 395 aa25.44■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 IMPACTQ9P2X3 320 aa25.44■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 PTMAP06454 111 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 CLDN10P78369 228 aa25.44■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 FAAP100Q0VG06 881 aa25.44■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 FAM212AQ96EL1 285 aa25.44■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 CGRRF1Q99675 332 aa25.44■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 CHST12Q9NRB3 414 aa25.44■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa25.44■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 PTPRJQ12913 1337 aa25.43■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa25.43■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 PITPNM1O00562 1244 aa25.43■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 MXI1P50539 228 aa25.43■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 NECAB2Q7Z6G3 386 aa25.43■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 TMEM117Q9H0C3 514 aa25.43■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 SCN5AQ14524 2016 aa25.43■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 TNNI1P19237 187 aa25.42■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 GBP6Q6ZN66 633 aa25.42■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 FAM84AQ96KN4 292 aa25.42■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 GCNT4Q9P109 453 aa25.42■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 GTF2H1P32780 548 aa25.41■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 SURF1Q15526 300 aa25.41■■□□□ 1.66
CLMN-205ENST00000556416 EXOC3L4Q17RC7 722 aa25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms