RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553277.5

LRP1-204, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP1, Length 1,693 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-204ENST00000553277 ASAP3Q8TDY4 903 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 SRGAP2O75044 1071 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 MOCS3O95396 460 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 POU5F1BQ06416 359 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 KCNA1Q09470 495 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 DRP2Q13474 957 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 CASP8Q14790 479 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 ASIC2Q16515 512 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 MTHFD1LQ6UB35 978 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 PSD3Q9NYI0 1048 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 K7ENM7 598 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 ASAP2O43150 1006 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 TGFB1I1O43294 461 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 MYL3P08590 195 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 PRKCIP41743 596 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 TMEM206Q9H813 350 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 MED4Q9NPJ6 270 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 KMT5AQ9NQR1 393 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 SLC16A4O15374 487 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 KLHL30Q0D2K2 578 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 MYBPC2Q14324 1141 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 BORCS6Q96GS4 357 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 CCDC169A6NNP5 214 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 GFPT2O94808 682 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 CAPSQ13938 189 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 GBP6Q6ZN66 633 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 FMNL3Q8IVF7 1028 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 CAPZA3Q96KX2 299 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 ACCSQ96QU6 501 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 TMEM134Q9H6X4 195 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 SETD4Q9NVD3 440 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 TBX20Q9UMR3 447 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 CES2O00748 559 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 AKAP3O75969 853 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 UCHL3P15374 230 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 PON1P27169 355 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 KCNA10Q16322 511 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 SESTD1Q86VW0 696 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 C12orf56Q8IXR9 622 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 LRRC71Q8N4P6 559 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 EXOC4Q96A65 974 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 TLR10Q9BXR5 811 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 DMAC2Q9NW81 257 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 SIP14410 1827 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 DENND3A2RUS2 1198 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 CABYRO75952 493 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 TMOD1P28289 359 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 PAFAH1B1P43034 410 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 EFNA5P52803 228 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 CXCL17Q6UXB2 119 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 RNF180Q86T96 592 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 SLC35C1Q96A29 364 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 GRID2IPA4D2P6 1211 aa20.21■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 ZNF185O15231 689 aa20.21■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 PIGRP01833 764 aa20.21■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 ASGR1P07306 291 aa20.21■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
LRP1-204ENST00000553277 TNFRSF8P28908 595 aa20.21■□□□□ 0.83
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