RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	MARCH5	Q9NX47	278 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	CLDND1	Q9NY35	253 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	CFAP45	Q9UL16	551 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TPCN1-223	ENST00000552985		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	TBX10	O75333	385 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	ALDH2	P05091	517 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	BMP1	P13497	986 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	GRM5	P41594	1212 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	OR1G1	P47890	313 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	OSTN	P61366	133 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	GRIK3	Q13003	919 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	SEZ6	Q53EL9	994 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	TMC7	Q7Z402	723 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	VPS52	Q8N1B4	723 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	KCNN1	Q92952	543 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	DHX58	Q96C10	678 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	TCHP	Q9BT92	498 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	ZBP1	Q9H171	429 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	TLE6	Q9H808	572 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	TBX20	Q9UMR3	447 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985		H0YCG3	227 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	TOM1L1	O75674	476 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	GLP2R	O95838	553 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	MCF2	P10911	925 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	ADAM15	Q13444	863 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	12.32	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	NAB2	Q15742	525 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	DUSP6	Q16828	381 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	RESP18	Q5W5W9	173 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	ZPBP2	Q6X784	338 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	EFHB	Q8N7U6	833 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	BICD1	Q96G01	975 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	CARNS1	A5YM72	827 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	TISP43	B9A030	160 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	NCK2	O43639	380 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	CXCL14	O95715	111 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	EFEMP2	O95967	443 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	PIGR	P01833	764 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	TH	P07101	528 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	CTSA	P10619	480 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	IDE	P14735	1019 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	LIG4	P49917	911 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	KRT85	P78386	507 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	GTF2B	Q00403	316 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	MCL1	Q07820	350 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	CLUL1	Q15846	466 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	AAK1	Q2M2I8	961 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	SNX27	Q96L92	541 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	SPATA32	Q96LK8	384 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	STRA6	Q9BX79	667 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	CLEC1B	Q9P126	229 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	VWA8	A3KMH1	1905 aa		12.31	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	ANK1	P16157	1881 aa		12.3	□□□□□ -0.44
TPCN1-223	ENST00000552985	C5orf42	Q9H799	3197 aa		12.3	□□□□□ -0.44

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