RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 MTERF2Q49AM1 385 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ZNF569Q5MCW4 686 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 CEP85LQ5SZL2 805 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 WDR78Q5VTH9 848 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 HGSNATQ68CP4 663 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 METTL7BQ6UX53 244 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 TAX1BP1Q86VP1 789 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 SLC35F6Q8N357 371 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 XXYLT1Q8NBI6 393 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 BSNDQ8WZ55 320 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 JAKMIP2Q96AA8 810 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 RMDN2Q96LZ7 410 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 CBWD1Q9BRT8 395 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 KIFC3Q9BVG8 833 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 TSGA10Q9BZW7 698 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 PDE11AQ9HCR9 933 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 HSPBP1Q9NZL4 362 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 GGA2Q9UJY4 613 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 GUCA1BQ9UMX6 200 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 FAN1Q9Y2M0 1017 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 DENND3A2RUS2 1198 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 CTAGE9A4FU28 777 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 TISP43B9A030 160 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 BTBD19C9JJ37 291 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 H0YCG3 227 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 PDHXO00330 501 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ZNF263O14978 683 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 MAPK13O15264 365 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 KRT86O43790 486 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 AKR1B10O60218 316 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 TLR2O60603 784 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 RASSF9O75901 435 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 GGPS1O95749 300 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 TRIM49P0CI25 452 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 TRIM49CP0CI26 452 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 CYP2C8P10632 490 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 FERP16591 822 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 SOX10P56693 466 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 CCNA1P78396 465 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 CYP27A1Q02318 531 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 TUBB2AQ13885 445 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 EMC2Q15006 297 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ASIC2Q16515 512 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 CCL15Q16663 113 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 LY6KQ17RY6 165 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 CBWD6Q4V339 395 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 CBWD3Q5JTY5 395 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 CBWD5Q5RIA9 395 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 CCDC122Q5T0U0 273 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 FAM160B1Q5W0V3 765 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 MICALCLQ6ZW33 695 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 EEPD1Q7L9B9 569 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 MSANTD4Q8NCY6 345 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ATL2Q8NHH9 583 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 MORC4Q8TE76 937 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 SEPT1Q8WYJ6 367 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 IFT74Q96LB3 600 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ALS2CR12Q96Q35 445 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 SPAG5Q96R06 1193 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 PCYT2Q99447 389 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 TUBB2BQ9BVA1 445 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 PCIF1Q9H4Z3 704 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 SIX2Q9NPC8 291 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 KLC4Q9NSK0 619 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 TRIM10Q9UDY6 481 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 MRFAP1Q9Y605 127 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 GOLGA6L10A6NI86 522 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ASB14A6NK59 587 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ZEB2O60315 1214 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 KIAA0754O94854 1291 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ARIH2O95376 493 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 PYGLP06737 847 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ADSSP30520 456 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 RFC5P40937 340 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms