RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542555.1

CLPB-211, Transcript of ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin, humanhuman

TSL 2

Gene CLPB, Length 421 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPB-211ENST00000542555 MARK3P27448 753 aa9.12□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 PPM1AP35813 382 aa9.12□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 SARSP49591 514 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 ADAM17P78536 824 aa9.12□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.12□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 C16orf46Q6P387 395 aa9.12□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa9.12□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 NME8Q8N427 588 aa9.12□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 TMEM105Q8N8V8 129 aa9.12□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 IL31RAQ8NI17 732 aa9.12□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 TCF25Q9BQ70 676 aa9.12□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa9.12□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 OSGEPQ9NPF4 335 aa9.12□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 PADI3Q9ULW8 664 aa9.12□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 LZTS1Q9Y250 596 aa9.12□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 B4E1Z4 1266 aa9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 GPR182O15218 404 aa9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 BRD1O95696 1058 aa9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 LMNAP02545 664 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 FOSL1P15407 271 aa9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 SDHBP21912 280 aa9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 ARL4DP49703 201 aa9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 TRDNQ13061 729 aa9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 TBC1D10CQ8IV04 446 aa9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 POU5F2Q8N7G0 328 aa9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 RASGRP4Q8TDF6 673 aa9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 S1PR5Q9H228 398 aa9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 ADAM7Q9H2U9 754 aa9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 GINS2Q9Y248 185 aa9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa9.11□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 RPS6KA5O75582 802 aa9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 KIF4AO95239 1232 aa9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 ERVFC1P60507 584 aa9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 PLCB3Q01970 1234 aa9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 TMEM62Q0P6H9 643 aa9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 ANGPT1Q15389 498 aa9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 ANKRD45Q5TZF3 282 aa9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 SLC24A5Q71RS6 500 aa9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 SLC7A3Q8WY07 619 aa9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 RILPL2Q969X0 211 aa9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 FAM227BQ96M60 508 aa9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 ZNF558Q96NG5 402 aa9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 ADAM19Q9H013 955 aa9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 RCAN3Q9UKA8 241 aa9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 NEDD4P46934 1319 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 A0A0D9SFI3 127 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 CARNS1A5YM72 827 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 C2CD4DB7Z1M9 353 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 MAFGO15525 162 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 INSRRP14616 1297 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 AOC1P19801 751 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 GATMP50440 423 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 RBM10P98175 930 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 APOBRQ0VD83 1088 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 PCNX4Q63HM2 1172 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 SYCE2Q6PIF2 218 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 CCDC105Q8IYK2 499 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 KIAA2013Q8IYS2 634 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 DTWD2Q8NBA8 298 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 VN1R2Q8NFZ6 395 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 GPRASP2Q96D09 838 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 PIGSQ96S52 555 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 ADAM2Q99965 735 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 SAP130Q9H0E3 1048 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 POMKQ9H5K3 350 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 BCAS3Q9H6U6 928 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 CYP26B1Q9NR63 512 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa9.09□□□□□ -0.95
CLPB-211ENST00000542555 SPG21Q9NZD8 308 aa9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms