RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, human

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STIP1-208	ENST00000540501	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		27.99	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	VWCE	Q96DN2	955 aa		27.99	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		27.99	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	THAP9	Q9H5L6	903 aa		27.99	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	ITGA4	P13612	1032 aa		27.98	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	TPM4	P67936	248 aa		27.98	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	CEP135	Q66GS9	1140 aa		27.98	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	CD302	Q8IX05	232 aa		27.98	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		27.98	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		27.98	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	HOXA2	O43364	376 aa		27.97	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	AMH	P03971	560 aa		27.97	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	ACR	P10323	421 aa		27.97	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	KCNJ6	P48051	423 aa		27.97	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	ENPEP	Q07075	957 aa		27.97	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		27.97	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	ZNF365	Q70YC5	407 aa		27.97	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		27.97	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	SAAL1	Q96ER3	474 aa		27.97	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		27.97	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		27.97	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		27.97	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		27.97	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		27.97	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		27.97	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	FAM189A1	O60320	539 aa		27.96	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	TMEM240	Q5SV17	173 aa		27.96	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	MED15	Q96RN5	788 aa		27.96	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
STIP1-208	ENST00000540501	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	IL18RAP	O95256	599 aa		27.95	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	ACOT2	P49753	483 aa		27.95	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		27.95	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		27.95	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		27.95	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		27.95	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		27.95	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	HERVK_113	Q902F9	699 aa		27.95	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	CBX8	Q9HC52	389 aa		27.95	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	SNTG2	Q9NY99	539 aa		27.95	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	PARP2	Q9UGN5	583 aa		27.95	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		27.94	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		27.94	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		27.94	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	KRT13	P13646	458 aa		27.94	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	SPAG1	Q07617	926 aa		27.94	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	IQCB1	Q15051	598 aa		27.94	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	TCTN1	Q2MV58	587 aa		27.94	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		27.94	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		27.94	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	ASB7	Q9H672	318 aa		27.94	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	AKAP3	O75969	853 aa		27.93	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	OSTN	P61366	133 aa		27.93	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		27.93	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		27.93	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		27.93	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		27.93	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	CEP120	Q8N960	986 aa		27.93	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	RDH13	Q8NBN7	331 aa		27.93	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		27.93	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	27.93	■■■□□ 2.06	9e-11	■□□□□ 9
STIP1-208	ENST00000540501	RSAD1	Q9HA92	442 aa		27.93	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	CEP290	O15078	2479 aa		27.93	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	RECQL4	O94761	1208 aa		27.92	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	ADRB2	P07550	413 aa		27.92	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	CASP4	P49662	377 aa		27.92	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	NCAPH	Q15003	741 aa		27.92	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		27.92	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	TMC2	Q8TDI7	906 aa		27.92	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	APOL6	Q9BWW8	343 aa		27.92	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	HES2	Q9Y543	173 aa		27.92	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	TRIP11	Q15643	1979 aa		27.91	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		27.91	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	ZBBX	A8MT70	800 aa		27.91	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	TNFSF9	P41273	254 aa		27.91	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	CYP24A1	Q07973	514 aa		27.91	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	PSMD6	Q15008	389 aa		27.91	■■■□□ 2.06
STIP1-208	ENST00000540501	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms