RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540240.1

C16orf62-212, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 633 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-212ENST00000540240 SHISA5Q8N114 240 aa8.76□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa8.76□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 POF1BQ8WVV4 589 aa8.76□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 PBXIP1Q96AQ6 731 aa8.76□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 PSTPIP2Q9H939 334 aa8.76□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.76□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 ADGRE2Q9UHX3 823 aa8.76□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa8.76□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa8.76□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa8.76□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa8.76□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 TMEM221A6NGB7 291 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 M0R296 226 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 LINC01565O15544 149 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 ATG7O95352 703 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 IGHDP01880 384 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 SRGAP2BP0DMP2 458 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 SCG2P13521 617 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 MARK3P27448 753 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 CD52P31358 61 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 SLC26A2P50443 739 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 IGBP1P78318 339 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 ZXDAP98168 799 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 PAK2Q13177 524 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 CASC1Q6TDU7 716 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF654Q8IZM8 581 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 FBXL6Q8N531 539 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 SMRP1Q8NCR6 262 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 PIBF1Q8WXW3 757 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 TLE6Q9H808 572 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 JADE2Q9NQC1 790 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 C1orf112Q9NSG2 853 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 SLC9A2Q9UBY0 812 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 PADI3Q9ULW8 664 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 SOX13Q9UN79 622 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 NCOR1O75376 2440 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 BDP1A6H8Y1 2624 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 REV3LO60673 3130 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 KAT6AQ92794 2004 aa8.75□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 CCDC69A6NI79 296 aa8.74□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 ITGB5P18084 799 aa8.74□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 CES1P23141 567 aa8.74□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 NRIP1P48552 1158 aa8.74□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 SARSP49591 514 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 STAT5BP51692 787 aa8.74□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 SIGLEC14Q08ET2 396 aa8.74□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 FDX2Q6P4F2 183 aa8.74□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 EDEM1Q92611 657 aa8.74□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 TMEM87BQ96K49 555 aa8.74□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 NEK1Q96PY6 1258 aa8.74□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 SDF4Q9BRK5 362 aa8.74□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 CHRDQ9H2X0 955 aa8.74□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 CLEC1BQ9P126 229 aa8.74□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.74□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 TELO2Q9Y4R8 837 aa8.74□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.74□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 NFASCO94856 1347 aa8.74□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 TTC3P53804 2025 aa8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 XIRP2A4UGR9 3374 aa8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 GPR182O15218 404 aa8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 HBP1O60381 514 aa8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 FOSP01100 380 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 DNAJB1P25685 340 aa8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 CHMLP26374 656 aa8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 MCM5P33992 734 aa8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 PTH1RQ03431 593 aa8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 PLCB4Q15147 1175 aa8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 TTC22Q5TAA0 569 aa8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 PRSS33Q8NF86 280 aa8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 ATP8B4Q8TF62 1192 aa8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 LINC01599Q8WXQ3 324 aa8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 MAP4K1Q92918 833 aa8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 MXRA8Q9BRK3 442 aa8.73□□□□□ -1.01
C16orf62-212ENST00000540240 IL25Q9H293 177 aa8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms