RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 CAPNS2Q96L46 248 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 ERAP1Q9NZ08 941 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 TRPC6Q9Y210 931 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 PPME1Q9Y570 386 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 GRID2IPA4D2P6 1211 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 HBP1O60381 514 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 FTCDO95954 541 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
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PACSIN3-211ENST00000539589 MXI1P50539 228 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 C2orf54Q08AI8 447 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC71Q8N4P6 559 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA4Q8NEY3 305 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 SOCS4Q8WXH5 440 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 APBA2Q99767 749 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 PPFIA4O75335 1185 aa21.89■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 ADRB2P07550 413 aa21.89■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 MMP3P08254 477 aa21.89■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 CAPSQ13938 189 aa21.89■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.89■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 HDXQ7Z353 690 aa21.89■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 CBWD2Q8IUF1 395 aa21.89■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 PLEKHO2Q8TD55 490 aa21.89■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 USP20Q9Y2K6 914 aa21.89■■□□□ 1.1
PACSIN3-211ENST00000539589 NAMPTP43490 491 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF22Q14807 665 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 USP37Q86T82 979 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 LMBR1Q8WVP7 490 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNN1Q92952 543 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 SUGCTQ9HAC7 445 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 L1RE1Q9UN81 338 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 MYH10P35580 1976 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 INSRRP14616 1297 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 PSMC4P43686 418 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 IRF5Q13568 498 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 POMGNT1Q8WZA1 660 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 SAAL1Q96ER3 474 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 SYT11Q9BT88 431 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 GABRQQ9UN88 632 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRIQ4A6NIV6 560 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 MAP2K7O14733 419 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 ALDH1A1P00352 501 aa21.87■■□□□ 1.09
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PACSIN3-211ENST00000539589 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 TMC2Q8TDI7 906 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXL18Q96ME1 805 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRN2O75325 713 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 TNFAIP3P21580 790 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 MAP9Q49MG5 647 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 IER5Q5VY09 327 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 PARD3BQ8TEW8 1205 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC127Q96BQ5 260 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 CREBZFQ9NS37 354 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 C22orf31O95567 290 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 GARTP22102 1010 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 SCP2P22307 547 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 GALCP54803 685 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 RPS6KA1Q15418 735 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT39Q6A163 491 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGEF19Q8IW93 802 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 TPCN2Q8NHX9 752 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 OLIG1Q8TAK6 271 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 TAF4BQ92750 862 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 BICD1Q96G01 975 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 MFSD14AQ96MC6 490 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 H3BRB1 525 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 GJB1P08034 283 aa21.85■■□□□ 1.09
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PACSIN3-211ENST00000539589 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC57Q8N9N7 239 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 RUBCNQ92622 972 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 HTTP42858 3142 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 A6NJR5 290 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 GTF2H1P32780 548 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 FCGRTP55899 365 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF484Q5JVG2 852 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 SYCE1Q8N0S2 351 aa21.85■■□□□ 1.09
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