RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538886.5

GGA3-202, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 3,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-202ENST00000538886 IQCF3P0C7M6 154 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 CXCL8P10145 99 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 CTNNB1P35222 781 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 RDXP35241 583 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 GUCY2FP51841 1108 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 EEF1DP3Q658K8 133 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 KLHDC9Q8NEP7 349 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 WNT8BQ93098 351 aa9.51□□□□□ -0.89
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GGA3-202ENST00000538886 ODF2LQ9ULJ1 636 aa9.51□□□□□ -0.89
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GGA3-202ENST00000538886 I3L4J1 428 aa9.5□□□□□ -0.89
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GGA3-202ENST00000538886 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 SPIRE1Q08AE8 756 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 C1orf186Q6ZWK4 172 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 PPM1KQ8N3J5 372 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 RNF217Q8TC41 542 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 AFAP1L1Q8TED9 768 aa9.5□□□□□ -0.89
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GGA3-202ENST00000538886 CASP4P49662 377 aa9.5□□□□□ -0.89
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GGA3-202ENST00000538886 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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GGA3-202ENST00000538886 SLC12A3P55017 1021 aa9.5□□□□□ -0.89
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GGA3-202ENST00000538886 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.899e-7■■■■□ 19.3
GGA3-202ENST00000538886 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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GGA3-202ENST00000538886 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
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GGA3-202ENST00000538886 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 RSAD1Q9HA92 442 aa9.49□□□□□ -0.89
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GGA3-202ENST00000538886 TNNC1P63316 161 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 ZNF720Q7Z2F6 126 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-202ENST00000538886 PPFIBP1Q86W92 1011 aa9.48□□□□□ -0.89
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