RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538266.5

SNHG1-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 3 BASIC

Gene SNHG1, Length 347 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-208	ENST00000538266	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	KIF3A	Q9Y496	699 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	MYH6	P13533	1939 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	RLF	Q13129	1914 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SHOX	O15266	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	KLF4	O43474	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CYTH3	O43739	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	FCER1A	P12319	257 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	XBP1	P17861	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	HOXD10	P28358	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	NAPA	P54920	295 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF445	P59923	1031 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	EGR3	Q06889	387 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	RBL2	Q08999	1139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SCRN1	Q12765	414 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	KCTD2	Q14681	263 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	NCAPH	Q15003	741 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ME3	Q16798	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	TKFC	Q3LXA3	575 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ABI1	Q8IZP0	508 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	NECAB1	Q8N987	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CHST13	Q8NET6	341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	WASF1	Q92558	559 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CUL5	Q93034	780 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PHKB	Q93100	1093 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	GTF3C6	Q969F1	213 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	FGD4	Q96M96	766 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PIGS	Q96S52	555 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	APBA2	Q99767	749 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	HDAC8	Q9BY41	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	BTBD7	Q9P203	1132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PFAS	O15067	1338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ABCB11	O95342	1321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	STK36	Q9NRP7	1315 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	FOXN1	O15353	648 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	STRN	O43815	780 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PEX10	O60683	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PPM1B	O75688	479 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CNMD	O75829	334 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	DEXI	O95424	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	LARGE1	O95461	756 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	EPHX1	P07099	455 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SCG2	P13521	617 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ITGA4	P13612	1032 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	IFNAR1	P17181	557 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PTMS	P20962	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PSMC4	P43686	418 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	LBX1	P52954	281 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	RAB33A	Q14088	237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	TRIM29	Q14134	588 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	NSMF	Q6X4W1	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	GPR142	Q7Z601	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms