RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FNBP1Q96RU3 617 aa9.25□□□□□ -0.93
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NDST4Q9H3R1 872 aa9.25□□□□□ -0.93
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NBNO60934 754 aa9.24□□□□□ -0.93
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRIM49CP0CI26 452 aa9.24□□□□□ -0.93
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UBXN11Q5T124 520 aa9.24□□□□□ -0.93
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TBX21Q9UL17 535 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HES2Q9Y543 173 aa9.24□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.24□□□□□ -0.93
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PHACTR2O75167 634 aa9.23□□□□□ -0.93
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMX1Q9H3N1 280 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM105AQ9NUU6 356 aa9.23□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KLK14Q9P0G3 267 aa9.23□□□□□ -0.93
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FMO5P49326 533 aa9.22□□□□□ -0.93
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ENPEPQ07075 957 aa9.22□□□□□ -0.93
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPNMBQ14956 572 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SYCP1Q15431 976 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC10A6Q3KNW5 377 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMC6Q7Z403 805 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM199Q8N511 208 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPC24Q8NBT2 197 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 APBB2Q92870 758 aa9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PGBD4Q96DM1 585 aa9.22□□□□□ -0.93
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