RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529998.5

UBASH3B-205, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 698 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-205ENST00000529998 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa9.51□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 DNAJB4Q9UDY4 337 aa9.51□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 PLAGL2Q9UPG8 496 aa9.51□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 RWDD3Q9Y3V2 267 aa9.51□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 MTCH2Q9Y6C9 303 aa9.51□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 ANK1P16157 1881 aa9.51□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 PTGESO14684 152 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 CLDN3O15551 220 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 ITGB1P05556 798 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 HARSP12081 509 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 FOSL2P15408 326 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 LAG3P18627 525 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 DNAJB1P25685 340 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 HOXD13P35453 343 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 GRM5P41594 1212 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 LIG4P49917 911 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 BCAR1P56945 870 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 MCL1Q07820 350 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 CAMK1Q14012 370 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 KCNT2Q6UVM3 1135 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 THNSL1Q8IYQ7 743 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 SPPL3Q8TCT6 385 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 URGCPQ8TCY9 931 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 RSPH1Q8WYR4 309 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 P2RX5Q93086 422 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 HVCN1Q96D96 273 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF558Q96NG5 402 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 PLVAPQ9BX97 442 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 AAASQ9NRG9 546 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 A0A0B4J269 797 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 FAM189A1O60320 539 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 NR1I2O75469 434 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 FGF18O76093 207 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 GALTP07902 379 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 ADSSP30520 456 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 ABCD1P33897 745 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 TNFSF9P41273 254 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 SLC11A1P49279 550 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 FAM160A1Q05DH4 1040 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 DSC1Q08554 894 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 DPYDQ12882 1025 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 NAB2Q15742 525 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 KMT5BQ4FZB7 885 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 FAM26FQ5R3K3 315 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 ALKAL1Q6UXT8 129 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 COLGALT2Q8IYK4 626 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 SLC39A11Q8N1S5 342 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF507Q8TCN5 953 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 ACAP3Q96P50 834 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 ACCSQ96QU6 501 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 SLC39A2Q9NP94 309 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 SPG21Q9NZD8 308 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 CACNG4Q9UBN1 327 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 STYXL1Q9Y6J8 313 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 MYO7AQ13402 2215 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 F8W810 466 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 NRP1O14786 923 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 OGTO15294 1046 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 CSPG5O95196 566 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 RPN1P04843 607 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 ALDH2P05091 517 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 MYL1P05976 194 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 THP07101 528 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 PLCB3Q01970 1234 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 GRIK3Q13003 919 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 STK4Q13043 487 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 PNOCQ13519 176 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 ALCAMQ13740 583 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-205ENST00000529998 SLC10A6Q3KNW5 377 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms