RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 RSPH1Q8WYR4 309 aa20.61■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.61■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.61■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.61■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 MBTPS2O43462 519 aa20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 FAM13AO94988 1023 aa20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 CXCL14O95715 111 aa20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 ALDH2P05091 517 aa20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 NCKAP1LP55160 1127 aa20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 GRIK3Q13003 919 aa20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 PTPN14Q15678 1187 aa20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 DYMQ7RTS9 669 aa20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 FIZ1Q96SL8 496 aa20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 KCND2Q9NZV8 630 aa20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 CD207Q9UJ71 328 aa20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 VWA8A3KMH1 1905 aa20.59■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 C2CD2LO14523 706 aa20.59■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 SPTLC2O15270 562 aa20.59■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 EFEMP2O95967 443 aa20.59■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 CTSAP10619 480 aa20.59■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 PROZP22891 400 aa20.59■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 DDIT3P35638 169 aa20.59■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF131P52739 623 aa20.59■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 KANK3Q6NY19 840 aa20.59■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 MYCT1Q8N699 235 aa20.59■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 PDILTQ8N807 584 aa20.59■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.59■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.59■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.59■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 MUC3AQ02505 3323 aa20.59■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 MYMKA6NI61 221 aa20.58■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 K7ENM7 598 aa20.58■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 TNFRSF10AO00220 468 aa20.58■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 NCK2O43639 380 aa20.58■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.58■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.58■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 STAMQ92783 540 aa20.58■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 GPR62Q9BZJ7 368 aa20.58■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa20.58■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
TSTA3-211ENST00000529899 NCOR1O75376 2440 aa20.58■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.58■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 TISP43B9A030 160 aa20.57■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 KIF4AO95239 1232 aa20.57■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 EPCAMP16422 314 aa20.57■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 SHC4Q6S5L8 630 aa20.57■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.57■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 SFR1Q86XK3 245 aa20.57■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.57■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa20.57■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 PARVGQ9HBI0 331 aa20.57■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 STK17AQ9UEE5 414 aa20.57■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.57■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 MYBP10242 640 aa20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 GRM5P41594 1212 aa20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 SMTNP53814 917 aa20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 STRN3Q13033 797 aa20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 TUSC3Q13454 348 aa20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 FUT10Q6P4F1 479 aa20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 DDX12PQ92771 950 aa20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 TCHPQ9BT92 498 aa20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 TCHHQ07283 1943 aa20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 TRAK2O60296 914 aa20.55■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 LILRB3O75022 631 aa20.55■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 YEATS4O95619 227 aa20.55■□□□□ 0.88
TSTA3-211ENST00000529899 SOD2P04179 222 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms