RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 GLIS3Q8NEA6 775 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 ZNF507Q8TCN5 953 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 KIFC3Q9BVG8 833 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 FZD8Q9H461 694 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 CDHR5Q9HBB8 845 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 SLC39A2Q9NP94 309 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 TLR9Q9NR96 1032 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 GDAQ9Y2T3 454 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 ZNF292O60281 2723 aa18.47■□□□□ 0.55
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PACS1-208ENST00000529677 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 MYBP10242 640 aa18.46■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 PPP1R2P41236 205 aa18.46■□□□□ 0.55
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PACS1-208ENST00000529677 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
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PACS1-208ENST00000529677 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
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PACS1-208ENST00000529677 KIF20AO95235 890 aa18.44■□□□□ 0.54
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PACS1-208ENST00000529677 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PACS1-208ENST00000529677 CACNA1BQ00975 2339 aa18.44■□□□□ 0.54
PACS1-208ENST00000529677 K7ERI5 159 aa18.43■□□□□ 0.54
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PACS1-208ENST00000529677 UPP2O95045 317 aa18.43■□□□□ 0.54
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PACS1-208ENST00000529677 PRCPP42785 496 aa18.43■□□□□ 0.54
PACS1-208ENST00000529677 ZNF445P59923 1031 aa18.43■□□□□ 0.54
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PACS1-208ENST00000529677 DPCR1Q3MIW9 517 aa18.43■□□□□ 0.54
PACS1-208ENST00000529677 ISM2Q6H9L7 571 aa18.43■□□□□ 0.54
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PACS1-208ENST00000529677 ACCSQ96QU6 501 aa18.43■□□□□ 0.54
PACS1-208ENST00000529677 TMEM206Q9H813 350 aa18.43■□□□□ 0.54
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PACS1-208ENST00000529677 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa18.43■□□□□ 0.54
PACS1-208ENST00000529677 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa18.42■□□□□ 0.54
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PACS1-208ENST00000529677 GLP2RO95838 553 aa18.42■□□□□ 0.54
PACS1-208ENST00000529677 PRKCBP05771 671 aa18.42■□□□□ 0.54
PACS1-208ENST00000529677 CCDC192P0DO97 292 aa18.42■□□□□ 0.54
PACS1-208ENST00000529677 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP18.42■□□□□ 0.54
PACS1-208ENST00000529677 CTNNB1P35222 781 aa18.42■□□□□ 0.54
PACS1-208ENST00000529677 KCNA1Q09470 495 aa18.42■□□□□ 0.54
PACS1-208ENST00000529677 LPIN1Q14693 890 aa18.42■□□□□ 0.54
PACS1-208ENST00000529677 ZCWPW2Q504Y3 356 aa18.42■□□□□ 0.54
PACS1-208ENST00000529677 ZPBP2Q6X784 338 aa18.42■□□□□ 0.54
PACS1-208ENST00000529677 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa18.42■□□□□ 0.54
PACS1-208ENST00000529677 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa18.42■□□□□ 0.54
PACS1-208ENST00000529677 FAM228AQ86W67 206 aa18.42■□□□□ 0.54
PACS1-208ENST00000529677 TMEM174Q8WUU8 243 aa18.42■□□□□ 0.54
PACS1-208ENST00000529677 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
PACS1-208ENST00000529677 LMAN2LQ9H0V9 348 aa18.42■□□□□ 0.54
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