RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa16.87■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 NME8Q8N427 588 aa16.87■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 PARD3BQ8TEW8 1205 aa16.87■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 KCNN1Q92952 543 aa16.87■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 RNF39Q9H2S5 420 aa16.87■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 M0QZ92 97 aa16.86■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 AFPP02771 609 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 GYPCP04921 128 aa16.86■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 AKAP5P24588 427 aa16.86■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 GJA8P48165 433 aa16.86■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 TRAF7Q6Q0C0 670 aa16.86■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 OR5B17Q8NGF7 314 aa16.86■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 MKNK1Q9BUB5 465 aa16.86■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa16.86■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 SIK3Q9Y2K2 1263 aa16.86■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 CDH23Q9H251 3354 aa16.86■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF233A6NK53 670 aa16.85■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 MGEA5O60502 916 aa16.85■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 RPS6KA5O75582 802 aa16.85■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 KRT13P13646 458 aa16.85■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 CDC25BP30305 580 aa16.85■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 CASP14P31944 242 aa16.85■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 LPIN1Q14693 890 aa16.85■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 SLFN12LQ6IEE8 588 aa16.85■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa16.85■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 RSPH3Q86UC2 560 aa16.85■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 MFSD14AQ96MC6 490 aa16.85■□□□□ 0.29
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TRPS1-206ENST00000517323 OGTO15294 1046 aa16.85■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 STAG3L1P0CL83 205 aa16.85■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 EN2P19622 333 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP16.85■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 FMO5P49326 533 aa16.85■□□□□ 0.29
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TRPS1-206ENST00000517323 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
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TRPS1-206ENST00000517323 PRIMPOLQ96LW4 560 aa16.85■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa16.85■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 KCNF1Q9H3M0 494 aa16.85■□□□□ 0.29
TRPS1-206ENST00000517323 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
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TRPS1-206ENST00000517323 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa16.85■□□□□ 0.29
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TRPS1-206ENST00000517323 MYBPC2Q14324 1141 aa16.84■□□□□ 0.29
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TRPS1-206ENST00000517323 UBXN11Q5T124 520 aa16.84■□□□□ 0.29
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TRPS1-206ENST00000517323 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
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TRPS1-206ENST00000517323 TMX1Q9H3N1 280 aa16.84■□□□□ 0.29
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TRPS1-206ENST00000517323 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
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TRPS1-206ENST00000517323 LPPQ93052 612 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPS1-206ENST00000517323 NLRC4Q9NPP4 1024 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPS1-206ENST00000517323 FAM170AA1A519 330 aa16.82■□□□□ 0.28
TRPS1-206ENST00000517323 NFICP08651 508 aa16.82■□□□□ 0.28
TRPS1-206ENST00000517323 PON1P27169 355 aa16.82■□□□□ 0.28
TRPS1-206ENST00000517323 MYL7Q01449 175 aa16.82■□□□□ 0.28
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TRPS1-206ENST00000517323 GPNMBQ14956 572 aa16.82■□□□□ 0.28
TRPS1-206ENST00000517323 TCTN1Q2MV58 587 aa16.82■□□□□ 0.28
TRPS1-206ENST00000517323 SLC10A6Q3KNW5 377 aa16.82■□□□□ 0.28
TRPS1-206ENST00000517323 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa16.82■□□□□ 0.28
TRPS1-206ENST00000517323 SLC27A1Q6PCB7 646 aa16.82■□□□□ 0.28
TRPS1-206ENST00000517323 MTMR12Q9C0I1 747 aa16.82■□□□□ 0.28
TRPS1-206ENST00000517323 LACTBL1A8MY62 500 aa16.82■□□□□ 0.28
TRPS1-206ENST00000517323 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
TRPS1-206ENST00000517323 CYP2C18P33260 490 aa16.82■□□□□ 0.28
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