RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 OAZ1P54368 228 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 POLE2P56282 527 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 RIPK4P57078 832 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 GABREP78334 506 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 FOXO4P98177 505 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 IKQ13123 557 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLN3Q13286 438 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 MORC3Q14149 939 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLEKHG6Q3KR16 790 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 MIDNQ504T8 468 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM83BQ5T0W9 1011 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 HMBOX1Q6NT76 420 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 NSMFQ6X4W1 530 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 LSMEM2Q8N112 164 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 SYNPOQ8N3V7 929 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC82Q8N4S0 544 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBR7Q8N806 425 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 KAT2BQ92831 832 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 MMS19Q96T76 1030 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 FUCA2Q9BTY2 467 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 APOL6Q9BWW8 343 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 CWH43Q9H720 699 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 IL21RQ9HBE5 538 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNF146Q9NTX7 359 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 GMIPQ9P107 970 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 LRP2BPQ9P2M1 347 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 TUBD1Q9UJT1 453 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 AKAP2Q9Y2D5 859 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 BTBD3Q9Y2F9 522 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMX2Q9Y320 296 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 IPPQ9Y573 584 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 MYH15Q9Y2K3 1946 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 DENND3A2RUS2 1198 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 CARNS1A5YM72 827 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP2A1O14983 1001 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 HOXA2O43364 376 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 SORBS3O60504 671 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 RFPL3O75679 317 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 WFS1O76024 890 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 GLUD1P00367 558 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 F2P00734 622 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ITGB3P05106 788 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADH1AP07327 375 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 INHBBP09529 407 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 FDX1P10109 184 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 CTSAP10619 480 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ALAS1P13196 640 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 BPIP17213 487 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 SARSP49591 514 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 CYP4F2P78329 520 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 NTHL1P78549 312 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP8B2P98198 1209 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 KLRB1Q12918 225 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 GRIK2Q13002 908 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 PAK2Q13177 524 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP2B3Q16720 1220 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 UVSSAQ2YD98 709 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 TKFCQ3LXA3 575 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 USH1GQ495M9 461 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 LRRC24Q50LG9 513 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 TXNDC11Q6PKC3 985 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 PI16Q6UXB8 463 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 CERS3Q8IU89 383 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAP4K3Q8IVH8 894 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC39A11Q8N1S5 342 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 LRRC43Q8N309 656 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 REPS2Q8NFH8 660 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINS1Q8NG48 757 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 ITFG1Q8TB96 612 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-548P-201ENST00000517083 COPS5Q92905 334 aa2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms