RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514815.1

PAPSS1-208, Transcript of 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, human

TSL 5

Gene PAPSS1, Length 296 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPSS1-208	ENST00000514815	PBX1	P40424	430 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PAPSS1-208	ENST00000514815	TNFSF9	P41273	254 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PAPSS1-208	ENST00000514815	GRM5	P41594	1212 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PAPSS1-208	ENST00000514815	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PAPSS1-208	ENST00000514815	PAK2	Q13177	524 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PAPSS1-208	ENST00000514815	KYAT1	Q16773	422 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PAPSS1-208	ENST00000514815	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PAPSS1-208	ENST00000514815	SEZ6	Q53EL9	994 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PAPSS1-208	ENST00000514815	UBXN11	Q5T124	520 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PAPSS1-208	ENST00000514815	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PAPSS1-208	ENST00000514815	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PAPSS1-208	ENST00000514815	USP37	Q86T82	979 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PAPSS1-208	ENST00000514815	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PAPSS1-208	ENST00000514815	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PAPSS1-208	ENST00000514815	CHST12	Q9NRB3	414 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PAPSS1-208	ENST00000514815	PADI3	Q9ULW8	664 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PAPSS1-208	ENST00000514815		A0A1W2PQC6	194 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	NPTXR	O95502	500 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	CLTA	P09496	248 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	TRIM49	P0CI25	452 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	TRIM49C	P0CI26	452 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	WNT7B	P56706	349 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	DLG4	P78352	724 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	CLDN10	P78369	228 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	UBXN1	Q04323	297 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	KCNH2	Q12809	1159 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	DSC3	Q14574	896 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	VSTM4	Q8IW00	320 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	TMX1	Q9H3N1	280 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	HIPK3	Q9H422	1215 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	CLTB	P09497	229 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	STAG3L1	P0CL83	205 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	CXCL8	P10145	99 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	FMO5	P49326	533 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	PPP3CA	Q08209	521 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	GPNMB	Q14956	572 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	TMEM192	Q8IY95	271 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	PMM2	O15305	246 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	STX10	O60499	249 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	MGEA5	O60502	916 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	NBN	O60934	754 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	IL18RAP	O95256	599 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	GTF2H1	P32780	548 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	OSTN	P61366	133 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	MYL7	Q01449	175 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	SURF1	Q15526	300 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	PTPN21	Q16825	1174 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	CBWD6	Q4V339	395 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	FNBP1	Q96RU3	617 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	CGRRF1	Q99675	332 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	PTPRJ	Q12913	1337 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	TTC26	A0AVF1	554 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	P4HA2	O15460	535 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	RECQL4	O94761	1208 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	GCLM	P48507	274 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	MXI1	P50539	228 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	SYCP1	Q15431	976 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	WDR49	Q8IV35	697 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PAPSS1-208	ENST00000514815	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19

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