RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511405.1

EPB41L4A-205, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4A, human

TSL 4

Gene EPB41L4A, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EPB41L4A-205	ENST00000511405	GGA3	Q9NZ52	723 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	C7orf72	A4D263	438 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	POM121B	A6NF01	834 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	CCDC154	A6NI56	674 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	FFAR2	O15552	330 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	FRS3	O43559	492 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	GFPT2	O94808	682 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	FSHB	P01225	129 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	TH	P07101	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	MTHFD2	P13995	350 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	TSHR	P16473	764 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	PRKCA	P17252	672 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	PAM	P19021	973 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	ELF1	P32519	619 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	IL12RB1	P42701	662 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	RAD52	P43351	418 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	HMGA2	P52926	109 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	SLC5A3	P53794	718 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	SLC16A1	P53985	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	SLURP1	P55000	103 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	CORO7	P57737	925 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	ERVFRD-1	P60508	538 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	LSAMP	Q13449	338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	LAPTM5	Q13571	262 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	STARD3	Q14849	445 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	POSTN	Q15063	836 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	TAF12	Q16514	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	GGT6	Q6P531	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	LDHD	Q86WU2	507 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	JAM3	Q9BX67	310 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405		A0A088AWK7	358 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405		B4E171	279 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	TISP43	B9A030	160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405		B9A039	149 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	MAN2B1	O00754	1011 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	MATN3	O15232	486 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	NCAM1	P13591	858 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	SDHB	P21912	280 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	TSPAN7	P41732	249 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	HSPA7	P48741	367 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	ZBED6	P86452	979 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	PRKG1	Q13976	671 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	TAF5	Q15542	800 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	MUM1	Q2TAK8	710 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	NUP43	Q8NFH3	380 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	DPF3	Q92784	378 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	NELL1	Q92832	810 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-205	ENST00000511405	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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