RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB33Q86T24 672 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 TSC2P49815 1807 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 K7ENM7 598 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 OSTNP61366 133 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPN14Q15678 1187 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 NAB2Q15742 525 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 FIZ1Q96SL8 496 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 CASTOR2A6NHX0 329 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 SPTLC2O15270 562 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 MBTPS2O43462 519 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM13AO94988 1023 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 EFEMP2O95967 443 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 CTSAP10619 480 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 TAS1R1Q7RTX1 841 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 HASPINQ8TF76 798 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 B3GALT6Q96L58 329 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 PANK2Q9BZ23 570 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 CD320Q9NPF0 282 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 STK17AQ9UEE5 414 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 CD207Q9UJ71 328 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 CDH22Q9UJ99 828 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 NCK2O43639 380 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 SEZ6Q53EL9 994 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 DYMQ7RTS9 669 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 MYCT1Q8N699 235 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 PDILTQ8N807 584 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 FEZF2Q8TBJ5 459 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 PARVGQ9HBI0 331 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-218ENST00000511185 MYMKA6NI61 221 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 TNFRSF10AO00220 468 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF4AO95239 1232 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 YEATS4O95619 227 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 DDIT3P35638 169 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 TXLNAP40222 546 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 GRM5P41594 1212 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 STRN3Q13033 797 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 TUSC3Q13454 348 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 SFR1Q86XK3 245 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 APOL5Q9BWW9 433 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 C2CD2LO14523 706 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP6R2O75170 966 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 CXCL14O95715 111 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 SOD2P04179 222 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 ALDH2P05091 517 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 STAT6P42226 847 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 SMTNP53814 917 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 SHC4Q6S5L8 630 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 SNX27Q96L92 541 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR62Q9BZJ7 368 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 TISP43B9A030 160 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAK2O60296 914 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 BRD1O95696 1058 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 MCF2P10911 925 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 EPCAMP16422 314 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 COASYQ13057 564 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms