RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 ADI1Q9BV57 179 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 WNT10BO00744 389 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 AGXTP21549 392 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 SREBF1P36956 1147 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 MCAMP43121 646 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 FLT3LGP49771 235 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 PER3P56645 1201 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 ANAPC15P60006 121 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF276Q8N554 614 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 OR7D4Q8NG98 312 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 NDC1Q9BTX1 674 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 BCO1Q9HAY6 547 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 LEFTY2O00292 366 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 TRIM24O15164 1050 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 PEX11BO96011 259 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 ADH4P08319 380 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 MAKP20794 623 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 NR4A1P22736 598 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 GUCY2FP51841 1108 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 EVA1CP58658 441 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 MTMR1Q13613 665 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 FHL2Q14192 279 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 SYT12Q8IV01 421 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 TFAP2CQ92754 450 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 MTMR8Q96EF0 704 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 MENTQ9BUN1 341 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 KCNH6Q9H252 994 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 LDAHQ9H6V9 325 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 DNM3Q9UQ16 869 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 TRIM75PA6NK02 468 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 KATNA1O75449 491 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 RECQL4O94761 1208 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 NHLH2Q02577 135 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 SEPT2Q15019 361 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 INAVAQ3KP66 663 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 PPM1NQ8N819 430 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 MRIQ9BWK5 157 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 MYH16Q9H6N6 1097 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 LANCL2Q9NS86 450 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 SLC52A1Q9NWF4 448 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 POGKQ9P215 609 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-215ENST00000506510 AHRRA9YTQ3 701 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 RAP2AP10114 183 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 MYBL2P10244 700 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 PTGS2P35354 604 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 SLC6A9P48067 706 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 FAM189BP81408 668 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 ITKQ08881 620 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 MGAT2Q10469 447 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 AFMIDQ63HM1 303 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 STON2Q8WXE9 905 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 MKS1Q9NXB0 559 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 ENDOD1O94919 500 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 FPR1P21462 350 aa6.26□□□□□ -1.41
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