RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.16□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRT222Q8N1A0 295 aa6.16□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.16□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa6.16□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 ERMNQ8TAM6 284 aa6.16□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBXN4Q92575 508 aa6.16□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 CALML4Q96GE6 196 aa6.16□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.16□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDHR1Q96JP9 859 aa6.16□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 AK8Q96MA6 479 aa6.16□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM20AQ96MK3 541 aa6.16□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 MED15Q96RN5 788 aa6.16□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 OSMRQ99650 979 aa6.16□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 PTPN18Q99952 460 aa6.16□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 PXMP2Q9NR77 195 aa6.16□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.16□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRWD1Q9UFC0 647 aa6.16□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 RWDD2AQ9UIY3 292 aa6.16□□□□□ -1.42
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.16□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNF114Q9Y508 228 aa6.16□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 PARP14Q460N5 1801 aa6.15□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYH7BA7E2Y1 1941 aa6.15□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 RLFQ13129 1914 aa6.15□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 RASSF10A6NK89 507 aa6.15□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.42
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CA12O43570 354 aa6.15□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 TLR2O60603 784 aa6.15□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 PEX10O60683 326 aa6.15□□□□□ -1.42
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ARHGEF3-215ENST00000498517 TADA3O75528 432 aa6.15□□□□□ -1.42
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CNMDO75829 334 aa6.15□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 TDP2O95551 362 aa6.15□□□□□ -1.42
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CASP1P29466 404 aa6.15□□□□□ -1.42
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ARHGEF3-215ENST00000498517 TRIM14Q14142 442 aa6.15□□□□□ -1.42
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.15□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
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ARHGEF3-215ENST00000498517 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.15□□□□□ -1.42
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ARHGEF3-215ENST00000498517 MXRA8Q9BRK3 442 aa6.15□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.15□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.15□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 CARD6Q9BX69 1037 aa6.15□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.15□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 TXNRD2Q9NNW7 524 aa6.15□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.15□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 MORF4L1Q9UBU8 362 aa6.15□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 CPA4Q9UI42 421 aa6.15□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.15□□□□□ -1.42
ARHGEF3-215ENST00000498517 PCNTO95613 3336 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC15A5A6NIM6 579 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNJ18B7U540 433 aa6.14□□□□□ -1.43
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ATP8B1O43520 1251 aa6.14□□□□□ -1.43
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ARHGEF3-215ENST00000498517 HOXD10P28358 340 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 STAT6P42226 847 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 COPB1P53618 953 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM193AP78312 1265 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 AMPD3Q01432 767 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 CNTN2Q02246 1040 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.14□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 MTMR1Q13613 665 aa6.14□□□□□ -1.43
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