RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RBM39-241ENST00000496183 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RBM39-241ENST00000496183 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-241ENST00000496183 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-241ENST00000496183 MENTQ9BUN1 341 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-241ENST00000496183 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RBM39-241ENST00000496183 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-241ENST00000496183 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RBM39-241ENST00000496183 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-241ENST00000496183 LANCL2Q9NS86 450 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-241ENST00000496183 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RBM39-241ENST00000496183 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-241ENST00000496183 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.34□□□□□ -1.39
RBM39-241ENST00000496183 CCDC88BA6NC98 1476 aa6.34□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 WDR97A6NE52 1622 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 DNMBPQ6XZF7 1577 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 GAGE12BA1L429 117 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 K7ESF4 209 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 RPS6KA4O75676 772 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 CFBP00751 764 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 HLA-DOAP06340 250 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 CANXP27824 592 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 INHBCP55103 352 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
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RBM39-241ENST00000496183 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 ATP2B3Q16720 1220 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 KCNK18Q7Z418 384 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 XYLT1Q86Y38 959 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 TSPEARQ8WU66 669 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 KCNH6Q9H252 994 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 TMEM140Q9NV12 185 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 FZD1Q9UP38 647 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 TOPBP1Q92547 1522 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 ZMYM3Q14202 1370 aa6.32□□□□□ -1.4
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RBM39-241ENST00000496183 SLPIP03973 132 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 ITGB1P05556 798 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 LAG3P18627 525 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 GPR3P46089 330 aa6.32□□□□□ -1.4
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RBM39-241ENST00000496183 PTPAQ15257 358 aa6.32□□□□□ -1.4
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RBM39-241ENST00000496183 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.32□□□□□ -1.4
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RBM39-241ENST00000496183 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.32□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 ABHD16AO95870 558 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 CLRN1P58418 232 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 DPTQ07507 201 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 NOMO1Q15155 1222 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 CLUL1Q15846 466 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.31□□□□□ -1.4
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RBM39-241ENST00000496183 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 CMIPQ8IY22 773 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 DRC7Q8IY82 874 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 COG1Q8WTW3 980 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 OSMP13725 252 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 MCAMP43121 646 aa6.3□□□□□ -1.4
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RBM39-241ENST00000496183 SLC16A1P53985 500 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 ERVK-21P61565 698 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 SLC25A3Q00325 362 aa6.3□□□□□ -1.4
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RBM39-241ENST00000496183 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 CNTD1Q8N815 330 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 SCOCQ9UIL1 159 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 ALG1L2C9J202 215 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 RAMP2O60895 175 aa6.29□□□□□ -1.4
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