RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	NPTX2	P47972	431 aa		19	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	NUCB2	P80303	420 aa		19	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	19	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	19	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	STK38	Q15208	465 aa		19	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	USP41	Q3LFD5	358 aa		19	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		19	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	19	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		19	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		19	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNH6	Q9H252	994 aa		19	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	PARP2	Q9UGN5	583 aa		19	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		19	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	CLIC4	Q9Y696	253 aa		19	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	BRD1	O95696	1058 aa		18.99	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	AKAP5	P24588	427 aa		18.99	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCD1	P33897	745 aa		18.99	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	UBA7	P41226	1012 aa		18.99	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	GLUD2	P49448	558 aa		18.99	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	CLCN4	P51793	760 aa		18.99	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	SMTN	P53814	917 aa		18.99	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		18.99	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		18.99	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		18.99	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		18.99	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	PDXDC1	Q6P996	788 aa		18.99	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		18.99	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	DAW1	Q8N136	415 aa		18.99	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	EDA	Q92838	391 aa		18.99	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		18.99	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		18.99	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	C5orf42	Q9H799	3197 aa		18.99	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	HIP1R	O75146	1068 aa		18.98	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	KLRC2	P26717	231 aa		18.98	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	TXLNA	P40222	546 aa		18.98	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	MAPK7	Q13164	816 aa		18.98	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		18.98	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	XKR4	Q5GH76	650 aa		18.98	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		18.98	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		18.98	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		18.98	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		18.98	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		18.98	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	CALML4	Q96GE6	196 aa		18.98	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXL18	Q96ME1	805 aa		18.98	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		18.98	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		18.98	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		18.98	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		18.98	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		18.97	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	PP2D1	A8MPX8	630 aa		18.97	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		18.97	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	PLS3	P13797	630 aa		18.97	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	CDC25A	P30304	524 aa		18.97	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	GRM5	P41594	1212 aa		18.97	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC12A3	P55017	1021 aa		18.97	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	PEX3	P56589	373 aa		18.97	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC39A14	Q15043	492 aa		18.97	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	CABP7	Q86V35	215 aa		18.97	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	UROC1	Q96N76	676 aa		18.97	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	PNMA5	Q96PV4	448 aa		18.97	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	USP28	Q96RU2	1077 aa		18.97	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	APOL6	Q9BWW8	343 aa		18.97	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	SNTG2	Q9NY99	539 aa		18.97	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	18.97	■□□□□ 0.63	9e-9	■■■■■ 81.8
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC169	A6NNP5	214 aa		18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	PTGES	O14684	152 aa		18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	TADA2A	O75478	443 aa		18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	RECQL4	O94761	1208 aa		18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	YEATS4	O95619	227 aa		18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	MCF2	P10911	925 aa		18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	PROZ	P22891	400 aa		18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	CA8	P35219	290 aa		18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	NAB2	Q15742	525 aa		18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	FUT10	Q6P4F1	479 aa		18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	ZPBP2	Q6X784	338 aa		18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	RTL10	Q7L3V2	364 aa		18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNK18	Q7Z418	384 aa		18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR149	Q86SP6	731 aa		18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		18.96	■□□□□ 0.63

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