RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	PLIN2	Q99541	437 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	JADE2	Q9NQC1	790 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	PICK1	Q9NRD5	415 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	GGA3	Q9NZ52	723 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	COL20A1	Q9P218	1284 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	DNM3	Q9UQ16	869 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PQJ5	194 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247		E9PMD0	336 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	NFIB	O00712	420 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	N4BP3	O15049	544 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	MAFG	O15525	162 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	STAM2	O75886	525 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	FLOT1	O75955	427 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	SLITRK3	O94933	977 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	UBE4B	O95155	1302 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	GNA14	O95837	355 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	GYPC	P04921	128 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	GAP43	P17677	238 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	ITGB5	P18084	799 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	GUCY2C	P25092	1073 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	STAT3	P40763	770 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	CDK17	Q00537	523 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	SPP2	Q13103	211 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	GIT2	Q14161	759 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	DOCK1	Q14185	1865 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	POU4F3	Q15319	338 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	MEA1	Q16626	185 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	MIIP	Q5JXC2	388 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	GPBP1	Q86WP2	473 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	STK35	Q8TDR2	534 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNN1	Q92952	543 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	GJA10	Q969M2	543 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	DNAJC7	Q99615	494 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	NUP58	Q9BVL2	599 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	PANK4	Q9NVE7	773 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	USP27X	A6NNY8	438 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	ZSCAN12	O43309	604 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	GAS7	O60861	476 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	CELA3A	P09093	270 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	AR	P10275	920 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	EPS15	P42566	896 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	PREP	P48147	710 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	RBL2	Q08999	1139 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	COG2	Q14746	738 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	MAN2A1	Q16706	1144 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	DYM	Q7RTS9	669 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATG4A-208	ENST00000489247	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		6.11	□□□□□ -1.43

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