RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 TMEM140Q9NV12 185 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 POLHQ9Y253 713 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 LAMTOR5O43504 91 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 ALDH2P05091 517 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 IL2RBP14784 551 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 CR2P20023 1033 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 GUCY1A2P33402 732 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 PTPN7P35236 360 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 GZMKP49863 264 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 RAB39AQ14964 217 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 SLFN13Q68D06 897 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 IL17RAQ96F46 866 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 TEPSINQ96N21 525 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 NELFAQ9H3P2 528 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PRX2 142 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 UBE2QL1A1L167 161 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 FAM227AF5H4B4 570 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 B3GALT2O43825 422 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 CDC14BO60729 498 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 GPR32O75388 356 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 TUSC2O75896 110 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 UBXN7O94888 489 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 ARIH2O95376 493 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 AMY1AP04745 511 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 MYL1P05976 194 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 SP140Q13342 867 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 OVCH2Q7RTZ1 564 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 GPR135Q8IZ08 494 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 C3orf20Q8ND61 904 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 REPS2Q8NFH8 660 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 MDM1Q8TC05 714 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 TTC17Q96AE7 1141 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 TIFAQ96CG3 184 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 TMX3Q96JJ7 454 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 CGRRF1Q99675 332 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 TCF25Q9BQ70 676 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 LDAHQ9H6V9 325 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 TEX33O43247 280 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 SYN1P17600 705 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 DDCP20711 480 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 HTR1BP28222 390 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 FLT3LGP49771 235 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 MAP2K6P52564 334 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 HK3P52790 923 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 ATP8B2P98198 1209 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 APBA1Q02410 837 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 NOGQ13253 232 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 MTM1Q13496 603 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 UBXN11Q5T124 520 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 IFI44Q8TCB0 444 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 RAB24Q969Q5 203 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 ARL8AQ96BM9 186 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 SAMD11Q96NU1 681 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 MYH16Q9H6N6 1097 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 HRGP04196 525 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 MYBP10242 640 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 CNR2P34972 360 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 TLE1Q04724 770 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 NFIXQ14938 502 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 CCDC157Q569K6 752 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 CYB5RLQ6IPT4 315 aa6.3□□□□□ -1.4
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