RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGAP44Q17R89 818 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 SPDYAQ5MJ70 313 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 SMIM5Q71RC9 77 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 FUKQ8N0W3 1084 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 CHST14Q8NCH0 376 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 SSH1Q8WYL5 1049 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 CLUHP3Q96NS8 147 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 ADOQ96SZ5 270 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 CABP5Q9NP86 173 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 BABAM1Q9NWV8 329 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 TNNQ9UQP3 1299 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 PALLDQ8WX93 1383 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 HEG1Q9ULI3 1381 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 BTAF1O14981 1849 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 GOLGA6L22H0YM25 854 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 A1BGP04217 495 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 MYL6BP14649 208 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 COMTP21964 271 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 FLT3P36888 993 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 GDF5P43026 501 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 RARSP54136 660 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 ITPK1Q13572 414 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 NFYCQ13952 458 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 TBR1Q16650 682 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 PROSER3Q2NL68 480 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 PIK3R6Q5UE93 754 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 G2E3Q7L622 706 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 OTOP1Q7RTM1 612 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 E2F7Q96AV8 911 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 OR10A2Q9H208 303 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 SMC4Q9NTJ3 1288 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 C5P01031 1676 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 KCPQ6ZWJ8 1503 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 PTPDC1A2A3K4 754 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 H7C1D1 291 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 RAD17O75943 681 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 ASMTLO95671 621 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 C6P13671 934 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 CANXP27824 592 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 MECP2P51608 486 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF460Q14592 562 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC144BQ3MJ40 725 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 DEFB132Q7Z7B7 95 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 OR14K1Q8NGZ2 314 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 FOXB1Q99853 325 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 PLA2G12BQ9BX93 195 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 VPS11Q9H270 941 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 KANSL2Q9H9L4 492 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 CHPF2Q9P2E5 772 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 EP400Q96L91 3159 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 NHSQ6T4R5 1651 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 PAPPAQ13219 1627 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 TACR2P21452 398 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 FNTBP49356 437 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF174Q15697 407 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 C20orf194Q5TEA3 1177 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC30Q5VVM6 783 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM68Q6AZZ1 485 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 POLNQ7Z5Q5 900 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 MENTQ9BUN1 341 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 STK31Q9BXU1 1019 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM260Q9NX78 707 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 UBR2Q8IWV8 1755 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 MATN2O00339 956 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 STARD3NLO95772 234 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 PRLP01236 227 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 JMJD7P0C870 316 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 RPS19P39019 145 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 RRP1P56182 461 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 SLC6A3Q01959 620 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 ROM1Q03395 351 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 TXNRD1Q16881 649 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 ALDH1L2Q3SY69 923 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA1958Q8N8K9 716 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 MRIQ9BWK5 157 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 ACSS2Q9NR19 701 aa5.92□□□□□ -1.46
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