RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483296.5

TIMM23B-204, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 23 homolog B, humanhuman

TSL 2

Gene TIMM23B, Length 1,156 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23B-204ENST00000483296 RNF39Q9H2S5 420 aa18.28■□□□□ 0.52
TIMM23B-204ENST00000483296 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa18.28■□□□□ 0.52
TIMM23B-204ENST00000483296 SLC39A2Q9NP94 309 aa18.28■□□□□ 0.52
TIMM23B-204ENST00000483296 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
TIMM23B-204ENST00000483296 TBC1D13Q9NVG8 400 aa18.28■□□□□ 0.52
TIMM23B-204ENST00000483296 STK39Q9UEW8 545 aa18.28■□□□□ 0.52
TIMM23B-204ENST00000483296 C5orf67F2Z3F1 127 aa18.27■□□□□ 0.52
TIMM23B-204ENST00000483296 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa18.27■□□□□ 0.52
TIMM23B-204ENST00000483296 ABLIM1O14639 778 aa18.27■□□□□ 0.52
TIMM23B-204ENST00000483296 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
TIMM23B-204ENST00000483296 PRR29P0C7W0 189 aa18.27■□□□□ 0.52
TIMM23B-204ENST00000483296 GATMP50440 423 aa18.27■□□□□ 0.52
TIMM23B-204ENST00000483296 BMT2Q1RMZ1 405 aa18.27■□□□□ 0.52
TIMM23B-204ENST00000483296 EPC2Q52LR7 807 aa18.27■□□□□ 0.52
TIMM23B-204ENST00000483296 THNSL1Q8IYQ7 743 aa18.27■□□□□ 0.52
TIMM23B-204ENST00000483296 HPS3Q969F9 1004 aa18.27■□□□□ 0.52
TIMM23B-204ENST00000483296 ZNF558Q96NG5 402 aa18.27■□□□□ 0.52
TIMM23B-204ENST00000483296 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
TIMM23B-204ENST00000483296 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
TIMM23B-204ENST00000483296 GDAQ9Y2T3 454 aa18.27■□□□□ 0.52
TIMM23B-204ENST00000483296 MEIS3P2A8K0S8 358 aa18.26■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 THP07101 528 aa18.26■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 PNOCQ13519 176 aa18.26■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 ARMCX5Q6P1M9 558 aa18.26■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 CD302Q8IX05 232 aa18.26■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 SCFD1Q8WVM8 642 aa18.26■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 TMEM175Q9BSA9 504 aa18.26■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 C17orf80Q9BSJ5 609 aa18.26■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 SLC38A7Q9NVC3 462 aa18.26■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 MTUS1Q9ULD2 1270 aa18.26■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 GBF1Q92538 1859 aa18.25■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 POMCP01189 267 aa18.25■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 ALDH2P05091 517 aa18.25■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 PPP1R2P41236 205 aa18.25■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 KRT17Q04695 432 aa18.25■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 PPP2R3AQ06190 1150 aa18.25■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 STK4Q13043 487 aa18.25■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 PTPROQ16827 1216 aa18.25■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 ZFP42Q96MM3 310 aa18.25■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 CWH43Q9H720 699 aa18.25■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 KIAA1586Q9HCI6 787 aa18.25■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 KLK14Q9P0G3 267 aa18.25■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 ANKRD63C9JTQ0 380 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 H3BNC9 293 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 XPOTO43592 962 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 SCNN1GP51170 649 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 OSTNP61366 133 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 UBE3AQ05086 875 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 KCNA1Q09470 495 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 STIM1Q13586 685 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 SLC39A4Q6P5W5 647 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 KCNT2Q6UVM3 1135 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 LRRC55Q6ZSA7 311 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 CEP120Q8N960 986 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 KIAA0895Q8NCT3 520 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 SPATA20Q8TB22 786 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 SNX27Q96L92 541 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 FAM161BQ96MY7 647 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 LMAN2LQ9H0V9 348 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 CERS4Q9HA82 394 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 LMBRD1Q9NUN5 540 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 MTMR10Q9NXD2 777 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 SPG21Q9NZD8 308 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa18.24■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 ARHGEF15O94989 841 aa18.23■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 MBD3O95983 291 aa18.23■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 LINC00271P0C7V0 271 aa18.23■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 BCAR1P56945 870 aa18.23■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 TUSC3Q13454 348 aa18.23■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 GPM6BQ13491 265 aa18.23■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 GRIN2CQ14957 1233 aa18.23■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 NELFCDQ8IXH7 590 aa18.23■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 TMEM169Q96HH4 297 aa18.23■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 UROC1Q96N76 676 aa18.23■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 PRDM12Q9H4Q4 367 aa18.23■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa18.23■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 LMCD1Q9NZU5 365 aa18.23■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 CNTN3Q9P232 1028 aa18.23■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 LZTS1Q9Y250 596 aa18.23■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 FAN1Q9Y2M0 1017 aa18.23■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 CALUO43852 315 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 EXTL3O43909 919 aa18.22■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 IL18RAPO95256 599 aa18.22■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 KCNE1P15382 129 aa18.22■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 PTMSP20962 102 aa18.22■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 ADSSP30520 456 aa18.22■□□□□ 0.51
TIMM23B-204ENST00000483296 DSC1Q08554 894 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms