RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 LUZP1Q86V48 1076 aa14.19□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 NT5DC4Q86YG4 428 aa14.19□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 BRSK2Q8IWQ3 736 aa14.19□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.19□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 DPF3Q92784 378 aa14.19□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 MFSD14AQ96MC6 490 aa14.19□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 ACAP3Q96P50 834 aa14.19□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 HAPLN2Q9GZV7 340 aa14.19□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 RNF39Q9H2S5 420 aa14.19□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.19□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.19□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa14.19□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 C9IYK1 514 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 STX10O60499 249 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 AKAP3O75969 853 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 ADRB2P07550 413 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 STAG3L1P0CL83 205 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 ITGB8P26012 769 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 AP3M2P53677 418 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 CCDC40Q4G0X9 1142 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 TMC2Q8TDI7 906 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 ASB7Q9H672 318 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 FANCLQ9NW38 375 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 USP20Q9Y2K6 914 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 IPPQ9Y573 584 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 KCNJ18B7U540 433 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 HOXA2O43364 376 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 HARSP12081 509 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 CSF2RAP15509 400 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 CYP24A1Q07973 514 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 BFSP1Q12934 665 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 KCNJ12Q14500 433 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 PSMD6Q15008 389 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 TCP11X2Q5H9J9 407 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 DEFB128Q7Z7B8 93 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 SAAL1Q96ER3 474 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 BORCS6Q96GS4 357 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 OSBPL7Q9BZF2 842 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 TMEM161AQ9NX61 479 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 DERAQ9Y315 318 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 LTBP2Q14767 1821 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 ENPP3O14638 875 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 INPPL1O15357 1258 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 MGEA5O60502 916 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 ITGA4P13612 1032 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 GTF2H1P32780 548 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 CASP4P49662 377 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 ACOT2P49753 483 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 CLDN10P78369 228 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 MAN2A1Q16706 1144 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 GAS2L3Q86XJ1 694 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 CBWD2Q8IUF1 395 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 RNF214Q8ND24 703 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 BADQ92934 168 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 FNBP1Q96RU3 617 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 HSD3B7Q9H2F3 369 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 C2CD2Q9Y426 696 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa14.15□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 TTC26A0AVF1 554 aa14.15□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 GOLGA8IPA6NC78 632 aa14.15□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 GOLGA8JA6NMD2 632 aa14.15□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 PMM2O15305 246 aa14.15□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 XPOTO43592 962 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 RECQL4O94761 1208 aa14.15□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 AMHP03971 560 aa14.15□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 TPM3P06753 285 aa14.15□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 RGS19P49795 217 aa14.15□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 VAMP7P51809 220 aa14.15□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 FILIP1LQ4L180 1135 aa14.15□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 XKR4Q5GH76 650 aa14.15□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 NPAS4Q8IUM7 802 aa14.15□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 WDR49Q8IV35 697 aa14.15□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 PARD3BQ8TEW8 1205 aa14.15□□□□□ -0.14
NISCH-208ENST00000481211 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms