RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTB-211ENST00000480301 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 PIGRP01833 764 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 GAP43P17677 238 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 OR1G1P47890 313 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 OSTNP61366 133 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 NAB2Q15742 525 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 IGFLR1Q9H665 355 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 MARCH5Q9NX47 278 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 NCK2O43639 380 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 NUCB2P80303 420 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 MCL1Q07820 350 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 ADALQ6DHV7 355 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 TMC7Q7Z402 723 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 VPS52Q8N1B4 723 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 ASB2Q96Q27 587 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 STRA6Q9BX79 667 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 ZBP1Q9H171 429 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 HIDE1A8MVS5 230 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 F8W810 466 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 CLDN3O15551 220 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 THP07101 528 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 IDEP14735 1019 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 ABCD1P33897 745 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 NRIP1P48552 1158 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 ADAM15Q13444 863 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 TUSC3Q13454 348 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 XKR4Q5GH76 650 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 BICD1Q96G01 975 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 TRIM9Q9C026 710 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 PANK4Q9NVE7 773 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 LINC01565O15544 149 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R37O75864 691 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 EFEMP2O95967 443 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 CMA1P23946 247 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 LTBRP36941 435 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 LIG4P49917 911 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 ACAP3Q96P50 834 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 TLE6Q9H808 572 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 CLDND1Q9NY35 253 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 REV3LO60673 3130 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 PER2O15055 1255 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 NR1I2O75469 434 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 KCNA5P22460 613 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 KCNQ1P51787 676 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 AMPD3Q01432 767 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 AAK1Q2M2I8 961 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 SEZ6Q53EL9 994 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 EFHBQ8N7U6 833 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 RABGGTAQ92696 567 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 HPSEQ9Y251 543 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 UNC80Q8N2C7 3258 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GVL5 298 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 CXCL14O95715 111 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 CTSAP10619 480 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-211ENST00000480301 PFKFB1P16118 471 aa22.9■■□□□ 1.26
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