RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 ANK1P16157 1881 aa28.2■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 LDHAP00338 332 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 ADRB2P07550 413 aa28.19■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 CKBP12277 381 aa28.19■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 NR1I3Q14994 352 aa28.19■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 FILIP1LQ4L180 1135 aa28.19■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 ZNF618Q5T7W0 954 aa28.19■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 ZBTB33Q86T24 672 aa28.19■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 CBWD2Q8IUF1 395 aa28.19■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 CDT1Q9H211 546 aa28.19■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 KIAA1586Q9HCI6 787 aa28.19■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa28.19■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 N4BP3O15049 544 aa28.18■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 FAM189A1O60320 539 aa28.18■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 CAGE1Q8TC20 777 aa28.18■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 FAM213AQ9BRX8 229 aa28.18■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 TANC1Q9C0D5 1861 aa28.18■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 CITO14578 2027 aa28.18■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 TPM2P07951 284 aa28.18■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 HARSP12081 509 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 AXLP30530 894 aa28.18■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 VWA3BQ502W6 1294 aa28.18■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 FBXO47Q5MNV8 452 aa28.18■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 TRAF7Q6Q0C0 670 aa28.18■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 DEFB128Q7Z7B8 93 aa28.18■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 LGALS16A8MUM7 142 aa28.17■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 OGTO15294 1046 aa28.17■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 RPS6KA5O75582 802 aa28.17■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 TPM3P06753 285 aa28.17■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 BFSP1Q12934 665 aa28.17■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP28.17■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 TEX33O43247 280 aa28.16■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 MCF2P10911 925 aa28.16■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 ACOT2P49753 483 aa28.16■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 BFSP2Q13515 415 aa28.16■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa28.16■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 NOTUMQ6P988 496 aa28.16■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 OTOP2Q7RTS6 562 aa28.16■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 CCDC155Q8N6L0 562 aa28.16■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 MFSD14AQ96MC6 490 aa28.16■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 NDST4Q9H3R1 872 aa28.16■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 SCN5AQ14524 2016 aa28.16■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 ZNF233A6NK53 670 aa28.15■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 PITPNM1O00562 1244 aa28.15■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 KRT13P13646 458 aa28.15■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 PPP2R3AQ06190 1150 aa28.15■■■□□ 2.1
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SOBP-202ENST00000477448 SLC35C1Q96A29 364 aa28.15■■■□□ 2.1
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SOBP-202ENST00000477448 OSBPL7Q9BZF2 842 aa28.15■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa28.15■■■□□ 2.1
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SOBP-202ENST00000477448 LPIN1Q14693 890 aa28.14■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 GPNMBQ14956 572 aa28.14■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 TRIP11Q15643 1979 aa28.14■■■□□ 2.1
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SOBP-202ENST00000477448 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 Q7L0L9 218 aa28.14■■■□□ 2.1
SOBP-202ENST00000477448 PLEKHO2Q8TD55 490 aa28.14■■■□□ 2.1
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SOBP-202ENST00000477448 GHRP10912 638 aa28.13■■■□□ 2.09
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SOBP-202ENST00000477448 VAMP7P51809 220 aa28.13■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 KCNH2Q12809 1159 aa28.13■■■□□ 2.09
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SOBP-202ENST00000477448 TCERG1LQ5VWI1 586 aa28.13■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 SLC27A1Q6PCB7 646 aa28.13■■■□□ 2.09
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SOBP-202ENST00000477448 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
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SOBP-202ENST00000477448 ERVK-5Q9HDB9 667 aa28.13■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 GRXCR1A8MXD5 290 aa28.12■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 SELPP16109 830 aa28.12■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 DLG4P78352 724 aa28.12■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 ENPEPQ07075 957 aa28.12■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 MBTPS1Q14703 1052 aa28.12■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 PTPN21Q16825 1174 aa28.12■■■□□ 2.09
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