RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476539.5

SUPT20H-214, Transcript of SPT20 homolog, SAGA complex component, humanhuman

TSL 3

Gene SUPT20H, Length 528 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20H-214ENST00000476539 PRIM2P49643 509 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 CASP5P51878 434 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 EPHB3P54753 998 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 PLS1Q14651 629 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 ATP2B3Q16720 1220 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 DGKKQ5KSL6 1271 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 PRR31Q5SQ13 230 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 ARTNQ5T4W7 220 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 TRIM68Q6AZZ1 485 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 CCHCR1Q8TD31 782 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 ANKS1AQ92625 1134 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 RAB24Q969Q5 203 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 RIPOR3Q96MK2 946 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 NOX5Q96PH1 765 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 PPCSQ9HAB8 311 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 PNPLA8Q9NP80 782 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 STARD7Q9NQZ5 370 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 PNPOQ9NVS9 261 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 GPRC5DQ9NZD1 345 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 OGDHLQ9ULD0 1010 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 LRCH1Q9Y2L9 728 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa5.07□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 F5H423 210 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 SYN1P17600 705 aa5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 MALP21145 153 aa5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 RPL13P26373 211 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 SLC7A1P30825 629 aa5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 GUCY1A2P33402 732 aa5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 IL13P35225 146 aa5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 PIK3CBP42338 1070 aa5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 LIMS1P48059 325 aa5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 ZNF827Q17R98 1081 aa5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 SAPCD2Q86UD0 394 aa5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 PLA2G15Q8NCC3 412 aa5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 IL31RAQ8NI17 732 aa5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 SUCLG2Q96I99 432 aa5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 NT5C1BQ96P26 610 aa5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 DMRTA2Q96SC8 542 aa5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 HERPUD2Q9BSE4 406 aa5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 KATNBL1Q9H079 304 aa5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 ZNF287Q9HBT7 754 aa5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 KIAA1586Q9HCI6 787 aa5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 STAP2Q9UGK3 403 aa5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 FAM184BQ9ULE4 1060 aa5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 CORO2BQ9UQ03 480 aa5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa5.06□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 MYO1FO00160 1098 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 KPNA5O15131 536 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 ADCY6O43306 1168 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 ITGA10O75578 1167 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 IL2RBP14784 551 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 BRAFP15056 766 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 DDCP20711 480 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 TNFSF4P23510 183 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 KIR2DL3P43628 341 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 MRE11P49959 708 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 DUSP2Q05923 314 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 ADAM15Q13444 863 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 MTM1Q13496 603 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 PCOLCEQ15113 449 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 TMEM95Q3KNT9 176 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 GAGE13Q4V321 117 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 IZUMO3Q5VZ72 239 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 PRR23BQ6ZRT6 265 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 ANKRD42Q8N9B4 389 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 POF1BQ8WVV4 589 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 SIGLEC10Q96LC7 697 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 COLEC11Q9BWP8 271 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 CARD11Q9BXL7 1154 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 OR10A2Q9H208 303 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 CERS4Q9HA82 394 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 ZFP64Q9NPA5 681 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 JADE2Q9NQC1 790 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 MOCS1Q9NZB8 636 aa5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 CCDC189A1A4V9 331 aa5.04□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 AMY1AP04745 511 aa5.04□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 JUNP05412 331 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 EN2P19622 333 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 STT3AP46977 705 aa5.04□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 CTXN1P60606 82 aa5.04□□□□□ -1.6
SUPT20H-214ENST00000476539 DLG4P78352 724 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms