RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472880.1

COL9A3-210, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL9A3, Length 959 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-210ENST00000472880 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
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COL9A3-210ENST00000472880 THP07101 528 aa21.79■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 SPATA31D3P0C874 917 aa21.79■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
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COL9A3-210ENST00000472880 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa21.79■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 HASPINQ8TF76 798 aa21.79■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 KIFAP3Q92845 792 aa21.79■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 PAAF1Q9BRP4 392 aa21.79■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 KIFC3Q9BVG8 833 aa21.79■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 RAB34Q9BZG1 259 aa21.79■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 PIDD1Q9HB75 910 aa21.79■■□□□ 1.08
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COL9A3-210ENST00000472880 STK24Q9Y6E0 443 aa21.79■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 PTGESO14684 152 aa21.78■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 TGM5O43548 720 aa21.78■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 EFNA5P52803 228 aa21.78■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa21.78■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 SNX29Q8TEQ0 813 aa21.78■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 KCNK12Q9HB15 430 aa21.78■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa21.78■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 DUSP12Q9UNI6 340 aa21.78■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 KIAA1024Q9UPX6 916 aa21.78■■□□□ 1.08
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COL9A3-210ENST00000472880 KIF4AO95239 1232 aa21.77■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 EDN1P05305 212 aa21.77■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 ECM1Q16610 540 aa21.77■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 RTP2Q5QGT7 225 aa21.77■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.77■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.77■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 TMEM105Q8N8V8 129 aa21.77■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 FAM86C1Q9NVL1 165 aa21.77■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21.77■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 GDAQ9Y2T3 454 aa21.77■■□□□ 1.08
COL9A3-210ENST00000472880 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.074e-7■■■□□ 15.2
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COL9A3-210ENST00000472880 PDIA5Q14554 519 aa21.76■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.76■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 FAM171A1Q5VUB5 890 aa21.76■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 CEP57Q86XR8 500 aa21.76■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 KIF2CQ99661 725 aa21.76■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 TTPALQ9BTX7 342 aa21.76■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 NT5C3AQ9H0P0 336 aa21.76■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 POLD4Q9HCU8 107 aa21.76■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 FBXL21Q9UKT6 434 aa21.76■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 PTGDRQ13258 359 aa21.75■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 PSMD5Q16401 504 aa21.75■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 LILRA6Q6PI73 481 aa21.75■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.75■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 PIK3R5Q8WYR1 880 aa21.75■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 PRKD2Q9BZL6 878 aa21.75■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 KIF3AQ9Y496 699 aa21.75■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.75■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa21.75■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
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COL9A3-210ENST00000472880 LAD1O00515 517 aa21.74■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 PAPLNO95428 1278 aa21.74■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 NAB2Q15742 525 aa21.74■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 KRT79Q5XKE5 535 aa21.74■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 PDXDC1Q6P996 788 aa21.74■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 FLCNQ8NFG4 579 aa21.74■■□□□ 1.07
COL9A3-210ENST00000472880 CXCL16Q9H2A7 254 aa21.74■■□□□ 1.07
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