RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466795.5

RNF13-206, Transcript of ring finger protein 13, human

TSL 4

Gene RNF13, Length 586 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF13-206	ENST00000466795		B8ZZF3	427 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	MUSK	O15146	869 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	GNAT2	P19087	354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	HK1	P19367	917 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	FLT3LG	P49771	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	RABGGTB	P53611	331 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	MIER2	Q8N344	545 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	EDA	Q92838	391 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	CSRNP2	Q9H175	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	EID1	Q9Y6B2	187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	GPR32	O75388	356 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	SCNN1G	P51170	649 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	ATP8B2	P98198	1209 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	HHEX	Q03014	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	SP140	Q13342	867 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	MTM1	Q13496	603 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	DOK3	Q7L591	496 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	NCAN	O14594	1321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	RAP2A	P10114	183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	RNF169	Q8NCN4	708 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	MYOC	Q99972	504 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	TDP1	Q9NUW8	608 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795		B5MCH6	92 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	PRRG2	O14669	202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	MFAP3L	O75121	409 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	POU2F2	P09086	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	IL2RB	P14784	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	DDC	P20711	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	PDC	P20941	246 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	ACRV1	P26436	265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	DSC2	Q02487	901 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	FAM83A	Q86UY5	434 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	MNT	Q99583	582 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	GPR87	Q9BY21	358 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms