RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPN3-209ENST00000466222 CPB2Q96IY4 423 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPN3-209ENST00000466222 FAM84AQ96KN4 292 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPN3-209ENST00000466222 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPN3-209ENST00000466222 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPN3-209ENST00000466222 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 A0A1W2PQY0 241 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 ACKR2O00590 384 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 KCNH2Q12809 1159 aa20.2■□□□□ 0.82
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CAPN3-209ENST00000466222 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 EEF1DP3Q658K8 133 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 SLC35C1Q96A29 364 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
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CAPN3-209ENST00000466222 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 ABLIM1O14639 778 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 WNT7BP56706 349 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 APBA1Q02410 837 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 POU5F1BQ06416 359 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 OR8K1Q8NGG5 319 aa20.19■□□□□ 0.82
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CAPN3-209ENST00000466222 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
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CAPN3-209ENST00000466222 NUP58Q9BVL2 599 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 A0A0B4J269 797 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 GARTP22102 1010 aa20.19■□□□□ 0.82
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CAPN3-209ENST00000466222 MYBPC2Q14324 1141 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 PTGISQ16647 500 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 DNAJC7Q99615 494 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.19■□□□□ 0.82
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CAPN3-209ENST00000466222 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 CLDN3O15551 220 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 TOM1L1O75674 476 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 CTSHP09668 335 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 ABCD1P33897 745 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 ATF7IP2Q5U623 682 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 ZPBP2Q6X784 338 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF410Q86VK4 478 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 SLC35F6Q8N357 371 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 ARRDC4Q8NCT1 418 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 MSTO1Q9BUK6 570 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 TSPAN1O60635 241 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 TNFSF9P41273 254 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 ARHGAP25P42331 645 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 KCNMA1Q12791 1236 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 BFSP1Q12934 665 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 SERINC5Q86VE9 423 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 SESTD1Q86VW0 696 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 GPD1LQ8N335 351 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 CEP120Q8N960 986 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 FBXL18Q96ME1 805 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.17■□□□□ 0.82
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CAPN3-209ENST00000466222 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 SCP2P22307 547 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 OSTNP61366 133 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 CBWD6Q4V339 395 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 STARD7Q9NQZ5 370 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 RAB21Q9UL25 225 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 EPHB6O15197 1021 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 FAM189A1O60320 539 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 ERLIN1O75477 346 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPN3-209ENST00000466222 NDUFA10O95299 355 aa20.16■□□□□ 0.82
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