RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 EPC2Q52LR7 807 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 CBWD3Q5JTY5 395 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 CBWD5Q5RIA9 395 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 CXCL17Q6UXB2 119 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 BAP1Q92560 729 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 ZBTB10Q96DT7 871 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 CGRRF1Q99675 332 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 MINDY3Q9H8M7 445 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 APEX2Q9UBZ4 518 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 TRIM17Q9Y577 477 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 TREHO43280 583 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 FAM189A1O60320 539 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 TSPAN1O60635 241 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 CCDC172P0C7W6 258 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 DARSP14868 501 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 SLC9A1P19634 815 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 ANXA13P27216 316 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 GCLMP48507 274 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 DLG4P78352 724 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 PPP3CAQ08209 521 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 GOLGA8FQ08AF8 430 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 C1orf220Q5T0J3 134 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 SFMBT2Q5VUG0 894 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 RRAGAQ7L523 313 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 WDR49Q8IV35 697 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 ARRDC4Q8NCT1 418 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 EHBP1Q8NDI1 1231 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 FBXL13Q8NEE6 735 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 DNAJB3Q8WWF6 145 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 CCDC127Q96BQ5 260 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 SPAG5Q96R06 1193 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 HAPLN2Q9GZV7 340 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 TMEM117Q9H0C3 514 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 CDT1Q9H211 546 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
NISCH-203ENST00000460759 A0A1B0GUA9 196 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 LRRC53A6NM62 1247 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 EPHB6O15197 1021 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 CAND2O75155 1236 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 TUBB4AP04350 444 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 CLTAP09496 248 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 CCDC175P0C221 793 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 DLATP10515 647 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 TNNI1P19237 187 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 ACOT2P49753 483 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 KIZQ2M2Z5 673 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 NOTUMQ6P988 496 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 RUFY4Q6ZNE9 571 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 CATSPER4Q7RTX7 472 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 SERINC5Q86VE9 423 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 TXLNBQ8N3L3 684 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 PLEKHO2Q8TD55 490 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 GLT1D1Q96MS3 346 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 PDZD7Q9H5P4 517 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 SIX2Q9NPC8 291 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 AIPL1Q9NZN9 384 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 B4GALT5O43286 388 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 B4GALT4O60513 344 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 SERPING1P05155 500 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 IQCF3P0C7M6 154 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 HARSP12081 509 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 CLCN1P35523 988 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 ACLYP53396 1101 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 ASIC2Q16515 512 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 ZACNQ401N2 412 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 FAM47CQ5HY64 1035 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 WDR59Q6PJI9 974 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 ZBTB33Q86T24 672 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 NT5DC4Q86YG4 428 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 CD302Q8IX05 232 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 OSMRQ99650 979 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 STK33Q9BYT3 514 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP13.94□□□□□ -0.18
NISCH-203ENST00000460759 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms