RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 GJD3Q8N144 294 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 AUTS2Q8WXX7 1259 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 CLIC6Q96NY7 704 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 REEP2Q9BRK0 252 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 TCHPQ9BT92 498 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 MARCH5Q9NX47 278 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 GDAQ9Y2T3 454 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 BDP1A6H8Y1 2624 aa25.24■■□□□ 1.63
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PTPN4-208ENST00000460289 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 PTPN14Q15678 1187 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF568Q3ZCX4 644 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 ANKRD54Q6NXT1 300 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 USP49Q70CQ1 688 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 PPFIBP1Q86W92 1011 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 ADHFE1Q8IWW8 467 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
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PTPN4-208ENST00000460289 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 STK17AQ9UEE5 414 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 FAM13AO94988 1023 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 MCF2P10911 925 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 YARSP54577 528 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 MYCT1Q8N699 235 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 PARVGQ9HBI0 331 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 MUC3AQ02505 3323 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 PTGESO14684 152 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 TOM1L1O75674 476 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 URODP06132 367 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 PROZP22891 400 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 GRM5P41594 1212 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF131P52739 623 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 NCKAP1LP55160 1127 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 STK38Q15208 465 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 RRAGBQ5VZM2 374 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 MPZL3Q6UWV2 235 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 ZPBP2Q6X784 338 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 HAUS6Q7Z4H7 955 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 KCNN1Q92952 543 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 CDT1Q9H211 546 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 ADAM28Q9UKQ2 775 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPN4-208ENST00000460289 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
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PTPN4-208ENST00000460289 TADA2AO75478 443 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 BRD1O95696 1058 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 EFEMP2O95967 443 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 ZP2Q05996 745 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
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PTPN4-208ENST00000460289 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 ZBTB33Q86T24 672 aa25.2■■□□□ 1.62
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PTPN4-208ENST00000460289 LINC00301Q8NCQ3 95 aa25.2■■□□□ 1.62
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PTPN4-208ENST00000460289 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 ABCD1P33897 745 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 GLUD2P49448 558 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 SYCE2Q6PIF2 218 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 TAS1R1Q7RTX1 841 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 ACAP3Q96P50 834 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 KLHL5Q96PQ7 755 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 S1PR5Q9H228 398 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 ZHX3Q9H4I2 956 aa25.19■■□□□ 1.62
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PTPN4-208ENST00000460289 C19orf67A6NJJ6 358 aa25.18■■□□□ 1.62
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PTPN4-208ENST00000460289 SPTLC2O15270 562 aa25.18■■□□□ 1.62
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PTPN4-208ENST00000460289 KIAA0319Q5VV43 1072 aa25.18■■□□□ 1.62
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PTPN4-208ENST00000460289 CXCL16Q9H2A7 254 aa25.18■■□□□ 1.62
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PTPN4-208ENST00000460289 DZANK1Q9NVP4 752 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 MYH11P35749 1972 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 CASTOR2A6NHX0 329 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 C2CD2LO14523 706 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 ABLIM1O14639 778 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 CLDN3O15551 220 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 YEATS4O95619 227 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 CNPP09543 421 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
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