RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446449.1

CREB1-208, Transcript of cAMP responsive element binding protein 1, human

TSL 3

Gene CREB1, Length 265 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CREB1-208	ENST00000446449	RNF169	Q8NCN4	708 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREB1-208	ENST00000446449	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREB1-208	ENST00000446449	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CREB1-208	ENST00000446449	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREB1-208	ENST00000446449	TTC1	Q99614	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CREB1-208	ENST00000446449	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREB1-208	ENST00000446449	HLA-DOA	P06340	250 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREB1-208	ENST00000446449	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
CREB1-208	ENST00000446449	AVPR1B	P47901	424 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREB1-208	ENST00000446449	FLT3LG	P49771	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREB1-208	ENST00000446449	GYS2	P54840	703 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREB1-208	ENST00000446449	GUCY1B3	Q02153	619 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREB1-208	ENST00000446449	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
CREB1-208	ENST00000446449	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREB1-208	ENST00000446449	RNF180	Q86T96	592 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREB1-208	ENST00000446449	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREB1-208	ENST00000446449	DPP7	Q9UHL4	492 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREB1-208	ENST00000446449	EDAR	Q9UNE0	448 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CREB1-208	ENST00000446449	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CREB1-208	ENST00000446449	DRGX	A6NNA5	263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	PJA2	O43164	708 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	ADCY6	O43306	1168 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	AKR1B10	O60218	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	PTPN7	P35236	360 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	CLRN1	P58418	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	CDK17	Q00537	523 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	MST1L	Q2TV78	715 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	METRNL	Q641Q3	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	GPR156	Q8NFN8	814 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	PIPSL	A2A3N6	862 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	KIAA0355	O15063	1070 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	HKR1	P10072	659 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	CHN2	P52757	468 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	STRN3	Q13033	797 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	REST	Q13127	1097 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	REPS2	Q8NFH8	660 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	NEU1	Q99519	415 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	ADAM2	Q99965	735 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	MXRA7	P84157	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	UBR7	Q8N806	425 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	OR7D4	Q8NG98	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	FATE1	Q969F0	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	CAVIN3	Q969G5	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	TBX22	Q9Y458	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	SPDEF	O95238	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	CFI	P05156	583 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	MTHFD2	P13995	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	ECHS1	P30084	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	SEC24C	P53992	1094 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	SP140	Q13342	867 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	ADRM1	Q16186	407 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	MUM1	Q2TAK8	710 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449		Q6ZVL8	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREB1-208	ENST00000446449	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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