RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PTPRCP08575 1304 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ASB14A6NK59 587 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ENC1O14682 589 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SRGAP3O43295 1099 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AKAP10O43572 662 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PI15O43692 258 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NDUFB10O96000 172 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AMHP03971 560 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GARTP22102 1010 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADH6P28332 368 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DDIT3P35638 169 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ETFBP38117 255 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CPT1AP50416 773 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RAB27AP51159 221 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATP11AP98196 1134 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRT76Q01546 638 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ANGPT1Q15389 498 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PCSK7Q16549 785 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF618Q5T7W0 954 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LCE2CQ5TA81 110 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NXNQ6DKJ4 435 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DGKHQ86XP1 1220 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SVOPQ8N4V2 548 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHST13Q8NET6 341 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DBF4BQ8NFT6 615 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VN1R2Q8NFZ6 395 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CYP2W1Q8TAV3 490 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SUSD6Q92537 303 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CSRNP2Q9H175 543 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ACAD9Q9H845 621 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VTA1Q9NP79 307 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RNF146Q9NTX7 359 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PATJQ8NI35 1801 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C5orf67F2Z3F1 127 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GREM1O60565 184 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EFCAB14O75071 495 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZBED4O75132 1171 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PF4P02776 101 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MMP1P03956 469 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NRIP1P48552 1158 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NEK2P51955 445 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TCEA2Q15560 299 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MUM1L1Q5H9M0 696 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPP4R3AQ6IN85 833 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SYT9Q86SS6 491 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LCA5Q86VQ0 697 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RASSF3Q86WH2 238 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SKAP1Q86WV1 359 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF354CQ86Y25 554 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LCORLQ8N3X6 602 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EFHBQ8N7U6 833 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SSH1Q8WYL5 1049 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KAT2BQ92831 832 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PGBD4Q96DM1 585 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 APOL5Q9BWW9 433 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FBXO40Q9UH90 709 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGF2RP11717 2491 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TTC3P53804 2025 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DOCK5Q9H7D0 1870 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C2CD2LO14523 706 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRKAB2O43741 272 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SIN3BO75182 1162 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PAGE1O75459 146 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARIH2O95376 493 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GHRHP01286 108 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ASGR2P07307 311 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADRB1P08588 477 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BMPR1AP36894 532 aa6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms