RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 KCNA5P22460 613 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 GUCY2CP25092 1073 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 SFNP31947 248 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 KLK7P49862 253 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 HSD17B4P51659 736 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 JAK3P52333 1124 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 GHRHRQ02643 423 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 DMTNQ08495 405 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 KCNH2Q12809 1159 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ITGA7Q13683 1181 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 CLUL1Q15846 466 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC18A3Q16572 532 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 MIER3Q7Z3K6 550 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 DEFB128Q7Z7B8 93 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 TPH2Q8IWU9 490 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 SYCE1Q8N0S2 351 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRSS33Q8NF86 280 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 REPS2Q8NFH8 660 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 RDM1Q8NG50 284 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 GDPD5Q8WTR4 605 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 BAP1Q92560 729 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 TBC1D5Q92609 795 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 TAF4BQ92750 862 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 HVCN1Q96D96 273 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 DRC1Q96MC2 740 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC9A7Q96T83 725 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 MXRA8Q9BRK3 442 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 LXNQ9BS40 222 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 MED4Q9NPJ6 270 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 FBXO28Q9NVF7 368 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 GCNT4Q9P109 453 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 SNX12Q9UMY4 172 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 EXOC7Q9UPT5 735 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 CFAP54Q96N23 3096 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 SIP14410 1827 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 BTNL10A8MVZ5 291 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 K7ENM7 598 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 MEIS1O00470 390 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 VWA5AO00534 786 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 OPLAHO14841 1288 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAP3K7O43318 606 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 SCP2P22307 547 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF131P52739 623 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 SNAP25P60880 206 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRT76Q01546 638 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 RINT1Q6NUQ1 792 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 NLRX1Q86UT6 975 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 HERC6Q8IVU3 1022 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 SYCP3Q8IZU3 236 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 DYDC2Q96IM9 177 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDHR1Q96JP9 859 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 PKNOX2Q96KN3 472 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 FGD4Q96M96 766 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 VIPAS39Q9H9C1 493 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 INTUQ9ULD6 942 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 SAMM50Q9Y512 469 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ASTN1O14525 1302 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF536O15090 1300 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1P1-201ENST00000437111 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SHQ1P1-201ENST00000437111 LCHNA4D1U4 455 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1P1-201ENST00000437111 H0YCG3 227 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1P1-201ENST00000437111 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SHQ1P1-201ENST00000437111 CES2O00748 559 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1P1-201ENST00000437111 STAM2O75886 525 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1P1-201ENST00000437111 CABYRO75952 493 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SHQ1P1-201ENST00000437111 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SHQ1P1-201ENST00000437111 RHOXF2BP0C7M4 288 aa6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms