RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 ATG7O95352 703 aa29.73■■■□□ 2.35
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CERS1-201ENST00000429504 DLATP10515 647 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
CERS1-201ENST00000429504 SP2Q02086 613 aa29.73■■■□□ 2.35
CERS1-201ENST00000429504 MTERF2Q49AM1 385 aa29.73■■■□□ 2.35
CERS1-201ENST00000429504 ZSWIM1Q9BR11 485 aa29.73■■■□□ 2.35
CERS1-201ENST00000429504 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
CERS1-201ENST00000429504 FAM170AA1A519 330 aa29.73■■■□□ 2.35
CERS1-201ENST00000429504 CYP1A2P05177 515 aa29.73■■■□□ 2.35
CERS1-201ENST00000429504 CLDN10P78369 228 aa29.73■■■□□ 2.35
CERS1-201ENST00000429504 LRRC31Q6UY01 552 aa29.73■■■□□ 2.35
CERS1-201ENST00000429504 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa29.73■■■□□ 2.35
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CERS1-201ENST00000429504 ACP6Q9NPH0 428 aa29.73■■■□□ 2.35
CERS1-201ENST00000429504 FAM114A2Q9NRY5 505 aa29.73■■■□□ 2.35
CERS1-201ENST00000429504 GTF3C4Q9UKN8 822 aa29.73■■■□□ 2.35
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CERS1-201ENST00000429504 HSPA6P17066 643 aa29.72■■■□□ 2.35
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CERS1-201ENST00000429504 ZNF302Q9NR11 478 aa29.72■■■□□ 2.35
CERS1-201ENST00000429504 STYXL1Q9Y6J8 313 aa29.72■■■□□ 2.35
CERS1-201ENST00000429504 LIG4P49917 911 aa29.71■■■□□ 2.35
CERS1-201ENST00000429504 LRIG3Q6UXM1 1119 aa29.71■■■□□ 2.35
CERS1-201ENST00000429504 RAB17Q9H0T7 212 aa29.71■■■□□ 2.35
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CERS1-201ENST00000429504 DAPK3O43293 454 aa29.7■■■□□ 2.35
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CERS1-201ENST00000429504 ATP4AP20648 1035 aa29.7■■■□□ 2.35
CERS1-201ENST00000429504 CYFIP1Q7L576 1253 aa29.7■■■□□ 2.35
CERS1-201ENST00000429504 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
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CERS1-201ENST00000429504 NEUROG2Q9H2A3 272 aa29.7■■■□□ 2.35
CERS1-201ENST00000429504 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
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CERS1-201ENST00000429504 TRPC6Q9Y210 931 aa29.7■■■□□ 2.35
CERS1-201ENST00000429504 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 SORBS3O60504 671 aa29.7■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 COMTP21964 271 aa29.7■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 SKOR1P84550 965 aa29.7■■■□□ 2.34
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CERS1-201ENST00000429504 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 PSMD6Q15008 389 aa29.7■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 NAA35Q5VZE5 725 aa29.7■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 KRT35Q92764 455 aa29.7■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 CD101Q93033 1021 aa29.7■■■□□ 2.34
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CERS1-201ENST00000429504 PORCNQ9H237 461 aa29.7■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 C1orf112Q9NSG2 853 aa29.7■■■□□ 2.34
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CERS1-201ENST00000429504 A6NNZ2 444 aa29.69■■■□□ 2.34
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CERS1-201ENST00000429504 HSD17B3P37058 310 aa29.69■■■□□ 2.34
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CERS1-201ENST00000429504 PEX5P50542 639 aa29.68■■■□□ 2.34
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CERS1-201ENST00000429504 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 ZNF653Q96CK0 615 aa29.68■■■□□ 2.34
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CERS1-201ENST00000429504 FAM187AA6NFU0 413 aa29.68■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
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CERS1-201ENST00000429504 DR1Q01658 176 aa29.68■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 MTMR3Q13615 1198 aa29.68■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 LBX2Q6XYB7 198 aa29.68■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 ERVK-5Q9HDB9 667 aa29.68■■■□□ 2.34
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CERS1-201ENST00000429504 USP2O75604 605 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
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CERS1-201ENST00000429504 ACAD10Q6JQN1 1059 aa29.67■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 ZNF516Q92618 1163 aa29.67■■■□□ 2.34
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CERS1-201ENST00000429504 OTOFQ9HC10 1997 aa29.67■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 MARCKSL1P49006 195 aa29.67■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 ZACNQ401N2 412 aa29.67■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 TMEM143Q96AN5 459 aa29.67■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 ARL2P36404 184 aa29.66■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa29.66■■■□□ 2.34
CERS1-201ENST00000429504 EMC10Q5UCC4 262 aa29.66■■■□□ 2.34
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