RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 POTEGQ6S5H5 508 aa15.34■□□□□ 0.05
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PTPRU-204ENST00000428026 DGKHQ86XP1 1220 aa15.34■□□□□ 0.05
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PTPRU-204ENST00000428026 ZNF667Q5HYK9 610 aa15.33■□□□□ 0.04
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PTPRU-204ENST00000428026 BATF3Q9NR55 127 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRU-204ENST00000428026 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRU-204ENST00000428026 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa15.33■□□□□ 0.04
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PTPRU-204ENST00000428026 SERPINB4P48594 390 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-204ENST00000428026 VAMP7P51809 220 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-204ENST00000428026 C1orf228Q6PIY5 440 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-204ENST00000428026 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-204ENST00000428026 GGA3Q9NZ52 723 aa15.32■□□□□ 0.04
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PTPRU-204ENST00000428026 TFR2Q9UP52 801 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-204ENST00000428026 PAMP19021 973 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-204ENST00000428026 KCNA4P22459 653 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-204ENST00000428026 HDAC4P56524 1084 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-204ENST00000428026 CORO7P57737 925 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-204ENST00000428026 FRA10AC1Q70Z53 315 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-204ENST00000428026 DNAJC9Q8WXX5 260 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-204ENST00000428026 PIK3R5Q8WYR1 880 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-204ENST00000428026 C9orf72Q96LT7 481 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-204ENST00000428026 ADNPQ9H2P0 1102 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-204ENST00000428026 ASNSD1Q9NWL6 643 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-204ENST00000428026 CARSP49589 748 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
PTPRU-204ENST00000428026 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
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