RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423327.2

SPC24-201, Transcript of SPC24, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SPC24, Length 840 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24-201ENST00000423327 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
SPC24-201ENST00000423327 TIPINQ9BVW5 301 aa17.02■□□□□ 0.32
SPC24-201ENST00000423327 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
SPC24-201ENST00000423327 GPR62Q9BZJ7 368 aa17.02■□□□□ 0.32
SPC24-201ENST00000423327 C17orf75Q9HAS0 396 aa17.02■□□□□ 0.32
SPC24-201ENST00000423327 KMT5AQ9NQR1 393 aa17.02■□□□□ 0.32
SPC24-201ENST00000423327 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
SPC24-201ENST00000423327 GDAQ9Y2T3 454 aa17.02■□□□□ 0.32
SPC24-201ENST00000423327 DENND4AQ7Z401 1863 aa17.01■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 C2orf16Q68DN1 1984 aa17.01■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 CASTOR2A6NHX0 329 aa17.01■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 LOC730098B7Z3J9 87 aa17.01■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 SLC26A4O43511 780 aa17.01■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 PLS3P13797 630 aa17.01■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 MCM6Q14566 821 aa17.01■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 SPECC1Q5M775 1068 aa17.01■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 KIAA0319Q5VV43 1072 aa17.01■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 FUT10Q6P4F1 479 aa17.01■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 SPIRE2Q8WWL2 714 aa17.01■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 EPSTI1Q96J88 318 aa17.01■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 REEP2Q9BRK0 252 aa17.01■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 KCND2Q9NZV8 630 aa17.01■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 FAM86C2PA6NEL3 165 aa17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 C2CD2LO14523 706 aa17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 CITO14578 2027 aa17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 KIF4AO95239 1232 aa17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 SRGAP2BP0DMP2 458 aa17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 MAPTP10636 758 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 UBA7P41226 1012 aa17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 CLCN4P51793 760 aa17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 TUSC3Q13454 348 aa17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 GIT2Q14161 759 aa17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 GLRA4Q5JXX5 417 aa17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 GPBP1Q86WP2 473 aa17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 HASPINQ8TF76 798 aa17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 RAD54LQ92698 747 aa17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 CLIC6Q96NY7 704 aa17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 USP28Q96RU2 1077 aa17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 FIZ1Q96SL8 496 aa17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 CCSER1Q9C0I3 900 aa17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 CHST7Q9NS84 486 aa17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 ADAM28Q9UKQ2 775 aa17■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 TEX28O15482 410 aa16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 STX6O43752 255 aa16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 BRD1O95696 1058 aa16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 URODP06132 367 aa16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 WEE2P0C1S8 567 aa16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 GRM5P41594 1212 aa16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 GLUD2P49448 558 aa16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 ZNF131P52739 623 aa16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 NCKAP1LP55160 1127 aa16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 DSG1Q02413 1049 aa16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 ZNF568Q3ZCX4 644 aa16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 CALML4Q96GE6 196 aa16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 HAPLN2Q9GZV7 340 aa16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 STK39Q9UEW8 545 aa16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 TECTAO75443 2155 aa16.98■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 THP07101 528 aa16.98■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 XKR4Q5GH76 650 aa16.98■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 CD300LGQ6UXG3 332 aa16.98■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 ALKAL1Q6UXT8 129 aa16.98■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 ZBTB33Q86T24 672 aa16.98■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 RNF135Q8IUD6 432 aa16.98■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 KCNN1Q92952 543 aa16.98■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 COLEC11Q9BWP8 271 aa16.98■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa16.98■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 ADAM7Q9H2U9 754 aa16.98■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 POMKQ9H5K3 350 aa16.98■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa16.98■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 RXFP1Q9HBX9 757 aa16.98■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 MUTYHQ9UIF7 546 aa16.98■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 ODF2LQ9ULJ1 636 aa16.98■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 TRIOO75962 3097 aa16.98■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 A0A087X0B3 334 aa16.97■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 DCXO43602 365 aa16.97■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 OSTNP61366 133 aa16.97■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 TPRNQ4KMQ1 711 aa16.97■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 RTP2Q5QGT7 225 aa16.97■□□□□ 0.31
SPC24-201ENST00000423327 MPZL3Q6UWV2 235 aa16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms