RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 CYBAP13498 195 aa22.71■■□□□ 1.23
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GPC1-202ENST00000420138 HIC1Q14526 733 aa22.71■■□□□ 1.23
GPC1-202ENST00000420138 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
GPC1-202ENST00000420138 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.71■■□□□ 1.23
GPC1-202ENST00000420138 SEZ6Q53EL9 994 aa22.71■■□□□ 1.23
GPC1-202ENST00000420138 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
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GPC1-202ENST00000420138 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
GPC1-202ENST00000420138 DEF6Q9H4E7 631 aa22.71■■□□□ 1.23
GPC1-202ENST00000420138 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.71■■□□□ 1.23
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GPC1-202ENST00000420138 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.7■■□□□ 1.22
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GPC1-202ENST00000420138 GPC3P51654 580 aa22.7■■□□□ 1.22
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GPC1-202ENST00000420138 FAM187BQ17R55 369 aa22.7■■□□□ 1.22
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GPC1-202ENST00000420138 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.7■■□□□ 1.22
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GPC1-202ENST00000420138 ERO1AQ96HE7 468 aa22.68■■□□□ 1.22
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GPC1-202ENST00000420138 SYT11Q9BT88 431 aa22.67■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 TCHPQ9BT92 498 aa22.67■■□□□ 1.22
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GPC1-202ENST00000420138 NENFQ9UMX5 172 aa22.67■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.67■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 GNRH1P01148 92 aa22.66■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.66■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 ZNF569Q5MCW4 686 aa22.66■■□□□ 1.22
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