RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 BMP1P13497 986 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 NMT1P30419 496 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 GRM5P41594 1212 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNQ1P51787 676 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 OSTNP61366 133 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 GRIK3Q13003 919 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 CHAMP1Q96JM3 812 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 COLEC11Q9BWP8 271 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 PTGESO14684 152 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC01565O15544 149 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 CLDN3O15551 220 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 THP07101 528 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 LTBRP36941 435 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 GTF2BQ00403 316 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 E2F4Q16254 413 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 LEXMQ3ZCV2 418 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 EFHBQ8N7U6 833 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 CEP120Q8N960 986 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 IQUBQ8NA54 791 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 DHX58Q96C10 678 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 BICD1Q96G01 975 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM13BQ9NYF5 915 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 XIRP2A4UGR9 3374 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 MYO7AQ13402 2215 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA1671Q9BY89 1806 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 H3BQ06 376 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 YARSP54577 528 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT85P78386 507 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 DUSP6Q16828 381 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 RESP18Q5W5W9 173 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF720Q7Z2F6 126 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 SFR1Q86XK3 245 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 STAMQ92783 540 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 ACAP3Q96P50 834 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 VN1R3Q9BXE9 311 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC27Q9C0I9 530 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBP1Q9H171 429 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 CUEDC2Q9H467 287 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 MARCH5Q9NX47 278 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 STK39Q9UEW8 545 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 C2orf71A6NGG8 1288 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 DLL1O00548 723 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 CTSAP10619 480 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 HARSP12081 509 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 IDEP14735 1019 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 GAP43P17677 238 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCD1P33897 745 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 CA8P35219 290 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.299e-7■■■■□ 23.8
SH3BP4-204ENST00000416021 LIG4P49917 911 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 MCL1Q07820 350 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 TUSC3Q13454 348 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 ALKAL1Q6UXT8 129 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 RABGGTAQ92696 567 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 SPATA32Q96LK8 384 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 KBTBD4Q9NVX7 518 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 SEL1LQ9UBV2 794 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 AMPD3Q01432 767 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 NAB2Q15742 525 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 TAS1R1Q7RTX1 841 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 AUTS2Q8WXX7 1259 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 HAPLN2Q9GZV7 340 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 TNMDQ9H2S6 317 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 PANK4Q9NVE7 773 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 TBC1D7Q9P0N9 293 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 F8W810 466 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 TADA2AO75478 443 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 PIGRP01833 764 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 SEZ6Q53EL9 994 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 XKR4Q5GH76 650 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 PAAF1Q9BRP4 392 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 CACNG4Q9UBN1 327 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4-204ENST00000416021 FRMD3A2A2Y4 597 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 CASTOR2A6NHX0 329 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 SOD2P04179 222 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 NDUFV1P49821 464 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 GLRA4Q5JXX5 417 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 ADALQ6DHV7 355 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP4K3Q8IVH8 894 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23.07■■□□□ 1.28
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